More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0432 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0432  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  615  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0236  helix-turn-helix domain-containing protein  83.28 
 
 		 351 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0214  AraC family transcriptional regulator  75.66 
 
 		 304 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0224  AraC family transcriptional regulator  75.66 
 
 		 304 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0204  AraC family transcriptional regulator  75.9 
 
 		 273 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0988  transcriptional regulator, AraC family  50.99 
 
 		 310 aa  275  7e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0224549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2203  Helix-turn-helix, AraC domain protein  47.73 
 
 		 311 aa  239  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263082  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2735  Helix-turn-helix, AraC domain protein  47.14 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.395  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2893  Helix-turn-helix, AraC domain protein  44.88 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2438  Helix-turn-helix, AraC domain protein  33.63 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170886  normal  0.130727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  36 
 
 		 1343 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03191  transcription regulator protein  51.28 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  36.36 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3152  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0294751  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  43.42 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  31.07 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  35.45 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.58 
 
 		 1396 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 353 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  41.86 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  34.86 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  46.03 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  46.03 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  28.7 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 351 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  28.7 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4246  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2556  AraC-like transcriptional regulator  37.8 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496188  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 283 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  37.11 
 
 		 276 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 259 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 283 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  36.25 
 
 		 286 aa  52.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 154 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 281 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 281 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 		 290 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 		 290 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 329 aa  52.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 129 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4422  transcriptional regulator, AraC family  38.96 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  39.47 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1931  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 118 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0129269  hitchhiker  0.0018191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  34.72 
 
 		 134 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  27.17 
 
 		 250 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6258  AraC family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1378  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  33.06 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 288 aa  50.4  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5953  AraC family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 336 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>