293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1359 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 246 aa  482  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  53.82 
 
 		 250 aa  234  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  50.6 
 
 		 251 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  48.39 
 
 		 268 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  48.93 
 
 		 250 aa  211  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  50.43 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  46.83 
 
 		 252 aa  208  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  49.01 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  49.6 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29130  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  49.02 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  45.6 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  43.78 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  50.81 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  47.66 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  46.69 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  46.31 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  45.69 
 
 		 267 aa  182  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  45.87 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  44.12 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  44.54 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  44.54 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  44.54 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  46.03 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2736  beta-lactamase domain protein  41.35 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.234606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  43.19 
 
 		 271 aa  161  9e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  43.7 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  38.67 
 
 		 267 aa  152  7e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  40.59 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  42.47 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  40 
 
 		 265 aa  148  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  40.98 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  41.22 
 
 		 246 aa  141  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  40.43 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1059  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III  38.97 
 
 		 284 aa  138  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.623679  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  35.6 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  35.6 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5275  beta-lactamase domain protein  36.43 
 
 		 263 aa  128  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  36.8 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  37.09 
 
 		 273 aa  123  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  31.64 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  34.23 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  30 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  32.22 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  30.45 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  30 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  30.45 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  30.49 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  30.42 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  30.8 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  30.71 
 
 		 244 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  30.71 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3623  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00997339  normal  0.648861 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  31.06 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  29.55 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  33.05 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  34.69 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1909  beta-lactamase domain-containing protein  33.04 
 
 		 259 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0640394  normal  0.612036 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2686  beta-lactamase domain-containing protein  31.23 
 
 		 248 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0241987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  34.01 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  36.36 
 
 		 251 aa  85.5  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  29.91 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1506  beta-lactamase domain-containing protein  33.47 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  28.96 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  26.16 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  28.74 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  29.82 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  28.07 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  26.27 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  33.03 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  26.27 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  26.82 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  26.27 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  26.27 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  26.27 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  26.27 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  28.24 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  26.27 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  26.27 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  36.5 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0819  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  31.08 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  26.27 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  27.81 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0184  beta-lactamase superfamily hydrolase  23.59 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  24.92 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0625  ribonuclease Z  22.15 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  26.94 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>