More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0474 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 318 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  41.85 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.92 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.42 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.27 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  38.34 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  37.71 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0769  hypothetical protein  34.43 
 
 		 306 aa  95.9  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.8 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.49 
 
 		 282 aa  93.2  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  29.53 
 
 		 315 aa  92.4  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  41.74 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  37.55 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2593  hypothetical protein  40.75 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  28.67 
 
 		 317 aa  85.9  9e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  40.1 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  29.25 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  36.84 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  32.78 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.63 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4041  hypothetical protein  35.67 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.83 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  35.89 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  26.69 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3308  drug/metabolite exporter (DME) family protein  34.74 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.61 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  28.3 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  32.63 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  30.61 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  36.67 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  30.24 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  32.2 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  32.2 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.36 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  28.16 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  28.42 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.24 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  27.49 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  28.92 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  27.3 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  27.89 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.93 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  34.52 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.19 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  24.83 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  21.82 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  29.01 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.9 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.91 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  29.26 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.52 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  24.52 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  31.73 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.52 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  24.52 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  26.75 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.19 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  24.21 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  30.03 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.29 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.19 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  28.17 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  25.48 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.19 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  29.52 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  26.09 
 
 		 292 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  32.75 
 
 		 294 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  24.55 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.19 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  30.13 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  26.73 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.31 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  27.24 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  25 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  25 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.31 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.67 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  28.43 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.72 
 
 		 292 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  25.4 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1950  hypothetical protein  23.86 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.24178  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  30.69 
 
 		 414 aa  53.9  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.83 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.99 
 
 		 296 aa  53.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.83 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.83 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  26.48 
 
 		 293 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  32.18 
 
 		 319 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.83 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.33 
 
 		 292 aa  53.1  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  30.18 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  29.75 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.49 
 
 		 311 aa  53.1  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  30.88 
 
 		 299 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  25 
 
 		 296 aa  53.1  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  27.27 
 
 		 322 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  28.87 
 
 		 292 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>