More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1737 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 277 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  77.62 
 
 		 277 aa  448  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  62.04 
 
 		 275 aa  358  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  54.91 
 
 		 340 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3127  response regulator receiver protein  52.03 
 
 		 283 aa  290  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1135  response regulator receiver protein  51.66 
 
 		 283 aa  291  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0978  response regulator receiver protein  48 
 
 		 280 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000299391  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2281  response regulator receiver protein  44 
 
 		 280 aa  241  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.217898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1942  response regulator receiver protein  44 
 
 		 280 aa  241  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2813  response regulator receiver protein  36.43 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2420  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1797  response regulator receiver protein  38.06 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0698667 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2262  response regulator receiver protein  36.63 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.02 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  38.13 
 
 		 554 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3274  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 383 aa  96.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0975  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 383 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  40.95 
 
 		 128 aa  95.9  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4068  response regulator receiver  44.95 
 
 		 377 aa  95.5  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.706307  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  39.5 
 
 		 124 aa  95.5  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  37.32 
 
 		 553 aa  94.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 123 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1577  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.16 
 
 		 314 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3790  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.3 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  42.14 
 
 		 553 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 123 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 123 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  36.92 
 
 		 356 aa  93.6  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  39.29 
 
 		 553 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3458  response regulator receiver  40.32 
 
 		 365 aa  92.8  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  37.01 
 
 		 1388 aa  92.4  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 		 122 aa  92  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 440 aa  92  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0978  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.5 
 
 		 322 aa  92  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.97362  decreased coverage  0.00116316 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0610  response regulator PleD  38.6 
 
 		 461 aa  92  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.961713  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 123 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0575  response regulator PleD  38.6 
 
 		 456 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  40.3 
 
 		 561 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 122 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0828  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.9 
 
 		 324 aa  91.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2064  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.16 
 
 		 395 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0065  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0584  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 1415 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  35.96 
 
 		 122 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 1907 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 125 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 234 aa  90.5  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 237 aa  90.5  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0378  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 204 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 122 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0360  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 204 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000726536 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 121 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 128 aa  89.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 333 aa  89.7  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 		 386 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 126 aa  89.4  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 124 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3408  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.13 
 
 		 346 aa  89.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 123 aa  89  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.13 
 
 		 310 aa  89  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  40.35 
 
 		 235 aa  89  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  43.27 
 
 		 795 aa  89  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  37.14 
 
 		 555 aa  89  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1134  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 138 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461969  hitchhiker  0.00297359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  37.9 
 
 		 373 aa  89  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  35.09 
 
 		 460 aa  88.2  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  40.35 
 
 		 457 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 121 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 		 386 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4060  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.28 
 
 		 365 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2955  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.19 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1155  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 132 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 125 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0356  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.82 
 
 		 360 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3553  response regulator receiver  36.13 
 
 		 384 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  38.18 
 
 		 1866 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 121 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1095  response regulator receiver domain-containing protein  35.59 
 
 		 138 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1223  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 132 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  38.6 
 
 		 457 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  37.61 
 
 		 230 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 125 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3535  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 134 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283754  normal  0.0368978 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.02 
 
 		 229 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 304 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 119 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  35.2 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 122 aa  87  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  36.84 
 
 		 461 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  36.21 
 
 		 120 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 1651 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  35.2 
 
 		 1427 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3072  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.16 
 
 		 353 aa  87  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000480818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>