62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1458 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  100 
 
 
1004 aa  2036    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  40.63 
 
 
998 aa  486  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  54 
 
 
792 aa  300  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0709  hypothetical protein  34.44 
 
 
733 aa  292  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.247349  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2340  peptidase C10 streptopain  34.1 
 
 
845 aa  228  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  48.85 
 
 
456 aa  218  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2456  secreted metalloprotease  29.5 
 
 
543 aa  217  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.055863 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2338  peptidase C10 streptopain  37.76 
 
 
841 aa  189  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193161  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  31.1 
 
 
566 aa  144  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2144  peptidase M6, immune inhibitor A  28.01 
 
 
513 aa  118  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0726754  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  27.49 
 
 
1406 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  45.73 
 
 
940 aa  112  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  28.13 
 
 
1076 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44694  metalloprotease  26.49 
 
 
1028 aa  107  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  25.93 
 
 
1096 aa  106  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  37.82 
 
 
1407 aa  104  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  41.34 
 
 
835 aa  99.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  25.45 
 
 
778 aa  99.8  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  28.38 
 
 
735 aa  96.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  37.36 
 
 
1514 aa  94.7  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  36.14 
 
 
331 aa  91.3  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  35.75 
 
 
2002 aa  90.5  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0603  M6 family metalloprotease domain protein  34.43 
 
 
1024 aa  89  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.460158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  25.65 
 
 
1825 aa  87.8  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3183  M6 family peptidase  27.71 
 
 
480 aa  87  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.585369  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  29.76 
 
 
1390 aa  87  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40744  predicted protein  32.81 
 
 
583 aa  83.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  38.55 
 
 
2117 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.67 
 
 
726 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  25.48 
 
 
885 aa  81.3  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3237  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.3 
 
 
1512 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2586  hypothetical protein  38.76 
 
 
582 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0849456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  41.57 
 
 
1027 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  49.43 
 
 
4357 aa  77.8  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.18 
 
 
1453 aa  77  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.18 
 
 
1451 aa  74.7  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  38.32 
 
 
864 aa  74.7  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.83 
 
 
1323 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  38.1 
 
 
1081 aa  68.2  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  44.05 
 
 
720 aa  65.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  41.51 
 
 
1263 aa  65.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3239  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.32 
 
 
1535 aa  62.4  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  33.14 
 
 
1095 aa  61.6  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1857  hypothetical protein  46.75 
 
 
321 aa  58.2  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000442866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  39.33 
 
 
1222 aa  57.8  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  33.55 
 
 
514 aa  57  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  35.16 
 
 
665 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3151  hypothetical protein  39.74 
 
 
96 aa  57  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137937  normal  0.0420775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  42.7 
 
 
2082 aa  55.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  31.79 
 
 
608 aa  53.5  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49918  predicted protein  26.73 
 
 
652 aa  53.5  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  24.09 
 
 
811 aa  52.8  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2455  hypothetical protein  24.34 
 
 
461 aa  51.6  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000334533  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  23.47 
 
 
751 aa  51.2  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  24.71 
 
 
994 aa  50.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1872  hypothetical protein  39.74 
 
 
848 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0860464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5246  hypothetical protein  31.46 
 
 
708 aa  49.3  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.733129 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1217  metalloprotease, putative  48.15 
 
 
839 aa  48.5  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000727805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  30.51 
 
 
1303 aa  47.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0647  hypothetical protein  31.3 
 
 
915 aa  47  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.449731  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  35 
 
 
917 aa  46.2  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  51.85 
 
 
826 aa  46.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>