More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1851 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  100 
 
 
263 aa  522  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  71.32 
 
 
261 aa  363  2e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  64.12 
 
 
257 aa  322  5e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  58.56 
 
 
257 aa  320  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  58.53 
 
 
256 aa  294  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  57.94 
 
 
252 aa  284  9e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  58.17 
 
 
248 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  56.97 
 
 
248 aa  271  7e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  56.97 
 
 
248 aa  271  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  54.86 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  54.94 
 
 
252 aa  261  6e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  51.91 
 
 
260 aa  258  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  52.57 
 
 
245 aa  251  9.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  53.09 
 
 
245 aa  238  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  48.03 
 
 
255 aa  229  5e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  46.83 
 
 
248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  45.64 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  46.03 
 
 
248 aa  219  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  46.03 
 
 
248 aa  218  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 
233 aa  217  1e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  46.47 
 
 
260 aa  216  4e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  45.85 
 
 
249 aa  215  7e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  43.58 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  46.03 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  45.23 
 
 
248 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  44.61 
 
 
260 aa  209  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  44.4 
 
 
248 aa  208  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  44.4 
 
 
248 aa  208  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  43.7 
 
 
262 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  42.8 
 
 
260 aa  206  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  43.24 
 
 
268 aa  205  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  42.63 
 
 
250 aa  202  7e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  43.32 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  45.04 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0051  ABC transporter  45.23 
 
 
238 aa  199  3e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0085  ABC transporter, ATP-binding protein  45.23 
 
 
238 aa  198  7e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  44.21 
 
 
296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 
254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  43.98 
 
 
248 aa  195  5.000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  41.85 
 
 
261 aa  195  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  43.95 
 
 
259 aa  192  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  40.65 
 
 
250 aa  193  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
251 aa  192  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  41.33 
 
 
261 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0350  ATPase  40.75 
 
 
292 aa  191  9e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  45.53 
 
 
295 aa  190  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  39.42 
 
 
248 aa  189  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  39.83 
 
 
255 aa  188  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
258 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  43.09 
 
 
257 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  43.09 
 
 
257 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  40.08 
 
 
248 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  42.8 
 
 
262 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  43.09 
 
 
257 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  40.89 
 
 
258 aa  185  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  43.31 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  40 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1498  ABC transporter related  40.16 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  38.34 
 
 
397 aa  183  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  42.45 
 
 
259 aa  181  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  44.31 
 
 
259 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2585  ABC transporter related  39.92 
 
 
259 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 
264 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  40.96 
 
 
261 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  39.22 
 
 
359 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  42.28 
 
 
276 aa  180  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  40.96 
 
 
261 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  39.09 
 
 
254 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  42.28 
 
 
272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  42.06 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  39.53 
 
 
378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  42.63 
 
 
278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  41.83 
 
 
272 aa  179  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  38.58 
 
 
357 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  42.68 
 
 
278 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0698  ABC transporter, ATP-binding protein  38.87 
 
 
242 aa  179  5.999999999999999e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  42.68 
 
 
278 aa  178  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  39.61 
 
 
363 aa  178  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  43.15 
 
 
292 aa  178  8e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  39.68 
 
 
359 aa  178  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.09 
 
 
264 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  42.34 
 
 
256 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  42.91 
 
 
258 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  42.63 
 
 
256 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  37.7 
 
 
362 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  37.7 
 
 
361 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  37.7 
 
 
361 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1212  ABC transporter related  38.59 
 
 
267 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00512006  hitchhiker  0.000000000503976 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1029  hypothetical protein  41.63 
 
 
250 aa  176  4e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  41.87 
 
 
276 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4716  ABC transporter related  43.9 
 
 
259 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592299  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4042  ABC transporter related  43.53 
 
 
258 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1922  ABC transporter related  43.09 
 
 
259 aa  176  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  37.3 
 
 
361 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  41.8 
 
 
294 aa  175  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  42.28 
 
 
257 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  42.28 
 
 
275 aa  175  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  41.6 
 
 
257 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  38.43 
 
 
333 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>