More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1546 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
424 aa  867    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  76.18 
 
 
424 aa  684    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  73.35 
 
 
424 aa  668    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  75.24 
 
 
424 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  71.76 
 
 
425 aa  633  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  69.1 
 
 
424 aa  608  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  66.59 
 
 
425 aa  565  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  57.35 
 
 
425 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  54.85 
 
 
444 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  54.14 
 
 
425 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  54.85 
 
 
444 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  54.14 
 
 
444 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  54.37 
 
 
425 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  52.01 
 
 
425 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  50.82 
 
 
425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  52.37 
 
 
424 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0158  FAD dependent oxidoreductase  53.32 
 
 
431 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  50.7 
 
 
425 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  51.42 
 
 
424 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0248  oxidoreductase, FAD-binding protein  52.37 
 
 
424 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  50.95 
 
 
424 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  49.77 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  51.55 
 
 
427 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6065  FAD dependent oxidoreductase  50.23 
 
 
441 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  50.58 
 
 
430 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
429 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6362  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
441 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542904  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  41.94 
 
 
427 aa  315  8e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 
425 aa  219  8.999999999999998e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 
435 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 
428 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  37.26 
 
 
425 aa  208  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 
432 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 
434 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 
436 aa  202  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 
430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 
435 aa  199  7.999999999999999e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0567  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
435 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 
429 aa  196  9e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  34.16 
 
 
427 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 
435 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 
441 aa  194  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 
435 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 
429 aa  193  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 
435 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
439 aa  193  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 
435 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  32.35 
 
 
435 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  33.5 
 
 
430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 
421 aa  190  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  35.1 
 
 
437 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  30.64 
 
 
482 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  33.15 
 
 
439 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  37.91 
 
 
468 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  33.91 
 
 
430 aa  189  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  37.91 
 
 
468 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  34.53 
 
 
431 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 
433 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  34.18 
 
 
430 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 
435 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 
435 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 
429 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4808  FAD dependent oxidoreductase  35.34 
 
 
429 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 
431 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  37.64 
 
 
468 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  35.9 
 
 
449 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 
430 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1813  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 
429 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00738573  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  36.22 
 
 
434 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0802  FAD dependent oxidoreductase  35.54 
 
 
429 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4020  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 
429 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.471109  normal  0.716709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1847  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 
429 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.948299  hitchhiker  0.00800428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  33.15 
 
 
437 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 
434 aa  186  8e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5383  FAD dependent oxidoreductase  35.18 
 
 
429 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199839  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3625  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 
429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.301202  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 
429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 
429 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  37.47 
 
 
443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  36.81 
 
 
440 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3719  FAD dependent oxidoreductase  35.46 
 
 
429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.0527853 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  36.89 
 
 
434 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  37.19 
 
 
434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  37.19 
 
 
434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  37.19 
 
 
434 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4903  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 
429 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
435 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3463  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 
429 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4280  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 
441 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.372193 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
435 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  30.85 
 
 
435 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 
437 aa  183  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 
427 aa  183  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 
436 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  33.76 
 
 
430 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 
433 aa  182  7e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  33.76 
 
 
430 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 
431 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  36.57 
 
 
439 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>