284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0120 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 232 aa  472  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  58.48 
 
 		 228 aa  265  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  58.18 
 
 		 262 aa  247  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  57.55 
 
 		 225 aa  244  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  59.62 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  53.42 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  56.11 
 
 		 220 aa  238  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  53.42 
 
 		 267 aa  238  5.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  54.47 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  56.42 
 
 		 218 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  55 
 
 		 218 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  56.19 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  54.09 
 
 		 218 aa  229  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  51.15 
 
 		 241 aa  229  3e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  54.21 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  54.71 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  52.7 
 
 		 237 aa  224  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  50.91 
 
 		 246 aa  224  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  52.7 
 
 		 237 aa  224  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  55.61 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  50.46 
 
 		 270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  55.61 
 
 		 244 aa  221  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  51.14 
 
 		 243 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  51.08 
 
 		 262 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  50.91 
 
 		 216 aa  214  5.9999999999999996e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  59.56 
 
 		 211 aa  214  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  53.88 
 
 		 255 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  52.65 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  57.41 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  58.47 
 
 		 235 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  56.07 
 
 		 241 aa  211  7.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  53.49 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  53.39 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  53 
 
 		 241 aa  208  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  55.39 
 
 		 217 aa  205  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  54.42 
 
 		 245 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  44.44 
 
 		 205 aa  202  4e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  43.58 
 
 		 214 aa  202  4e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  55.35 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  50.9 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  48.86 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  48.08 
 
 		 223 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  43.12 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  49.33 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  40.19 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  37.28 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  39.68 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  35.98 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  39.15 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  42.19 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  36.1 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  39.02 
 
 		 213 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  39.02 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  41.15 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  42.55 
 
 		 203 aa  125  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  36.64 
 
 		 221 aa  125  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  39.17 
 
 		 234 aa  124  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3935  lipoate-protein ligase B  37.04 
 
 		 230 aa  124  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385529  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2569  lipoate-protein ligase B  37.19 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2199  lipoate-protein ligase B  37.19 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0165634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  38 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  39.44 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  36.56 
 
 		 216 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  37.66 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  36.22 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  36.23 
 
 		 227 aa  122  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  35.48 
 
 		 219 aa  121  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  36.26 
 
 		 199 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  36.26 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  45.51 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1962  lipoyltransferase  36.7 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0677  lipoate-protein ligase B  40.35 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000835576  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  38.57 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0737  lipoate-protein ligase B  40.35 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00974636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0795  lipoate-protein ligase B  40.35 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0561601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  33.94 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0751  lipoate-protein ligase B  40.35 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  39.07 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0691  lipoate-protein ligase B  40.35 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0223479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0243  lipoate-protein ligase B  37.69 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00599  lipoyltransferase  39.88 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.279219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2996  lipoate-protein ligase B  39.88 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000404863  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0621  lipoate-protein ligase B  39.88 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0655  lipoate-protein ligase B  39.88 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000162879  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0718  lipoate-protein ligase B  39.88 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2630  lipoate-protein ligase B  37.85 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3015  lipoate-protein ligase B  39.88 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0323475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  37.56 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0682  lipoate-protein ligase B  39.88 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000064187  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  41.27 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4880  lipoate-protein ligase B  38.21 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00588  hypothetical protein  39.88 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277284  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  40.7 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  36.27 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  33.87 
 
 		 219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000923711  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 		 227 aa  118  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>