More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4074 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4074  aminotransferase class-III  100 
 
 		 443 aa  885    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  78.83 
 
 		 425 aa  634    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  68.97 
 
 		 419 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  67.3 
 
 		 417 aa  548  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  65.37 
 
 		 418 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  55.74 
 
 		 419 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0827  aminotransferase class-III  53.59 
 
 		 422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0491  aminotransferase  54.22 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  48.17 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  46.33 
 
 		 442 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0700  aminotransferase class-III  48.77 
 
 		 421 aa  359  5e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  43.29 
 
 		 428 aa  336  5e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  42.52 
 
 		 427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  42.89 
 
 		 461 aa  322  7e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  40.53 
 
 		 444 aa  319  6e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00880  ornithine-oxo-acid aminotransferase, putative  43.31 
 
 		 476 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  42.89 
 
 		 465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04690  aminotransferase, putative  41.55 
 
 		 479 aa  313  5.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  41.26 
 
 		 452 aa  312  6.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  40.94 
 
 		 445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  41.44 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  38.24 
 
 		 478 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  38.24 
 
 		 454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  43.96 
 
 		 432 aa  306  7e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  38.24 
 
 		 454 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  38.24 
 
 		 454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  38.24 
 
 		 454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  38.24 
 
 		 454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  37.75 
 
 		 479 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  37.75 
 
 		 468 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  37.75 
 
 		 454 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  39.9 
 
 		 430 aa  301  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  43.28 
 
 		 434 aa  300  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  37.5 
 
 		 454 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  41.36 
 
 		 428 aa  297  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  41.36 
 
 		 465 aa  297  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  42.6 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  37.91 
 
 		 425 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  37.91 
 
 		 425 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  37.66 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  43.05 
 
 		 458 aa  292  6e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  37.91 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  36.87 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  36.27 
 
 		 454 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  37.91 
 
 		 425 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  40.45 
 
 		 420 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  40.5 
 
 		 439 aa  287  2.9999999999999996e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  39.9 
 
 		 434 aa  286  5.999999999999999e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  37.39 
 
 		 430 aa  285  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  38.17 
 
 		 430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  41.5 
 
 		 433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  41.06 
 
 		 447 aa  283  6.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  38.23 
 
 		 439 aa  280  4e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  40.05 
 
 		 448 aa  280  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  40.25 
 
 		 440 aa  279  7e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  39.95 
 
 		 438 aa  279  8e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  38.32 
 
 		 426 aa  279  9e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  34.67 
 
 		 448 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  39.91 
 
 		 441 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  40.34 
 
 		 422 aa  277  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  40 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  36.64 
 
 		 430 aa  276  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  39.25 
 
 		 427 aa  275  8e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0007  aminotransferase class-III  36.3 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.383992  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  36.53 
 
 		 440 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  39.95 
 
 		 431 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  37 
 
 		 426 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  37 
 
 		 426 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  39.26 
 
 		 440 aa  272  7e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5663  4-aminobutyrate aminotransferase  41.55 
 
 		 429 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  37.12 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  36.79 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  36.53 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  36.53 
 
 		 427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  38.94 
 
 		 427 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  37.5 
 
 		 426 aa  269  7e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  37.5 
 
 		 426 aa  269  7e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  37.5 
 
 		 426 aa  269  7e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  37.12 
 
 		 426 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  37.12 
 
 		 426 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  39.9 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0293  hypothetical protein  36.55 
 
 		 450 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  37.12 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  40.61 
 
 		 426 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  37.5 
 
 		 426 aa  268  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  36.3 
 
 		 427 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  35.7 
 
 		 432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  39.9 
 
 		 425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  39.64 
 
 		 426 aa  267  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  39.53 
 
 		 446 aa  266  5e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1289  4-aminobutyrate aminotransferase  38.27 
 
 		 426 aa  266  5.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  38.44 
 
 		 430 aa  266  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  37.71 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  39.3 
 
 		 426 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  34.78 
 
 		 425 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  42.38 
 
 		 433 aa  264  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0309  hypothetical protein  36.85 
 
 		 450 aa  263  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0117  aminotransferase class-III  39.31 
 
 		 453 aa  263  4.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.457647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0848  4-aminobutyrate aminotransferase  38.92 
 
 		 425 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  36.34 
 
 		 427 aa  263  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>