106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1091 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 319 aa  653    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  94.36 
 
 		 319 aa  622  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  60.39 
 
 		 335 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  41.28 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  44.44 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  42.35 
 
 		 314 aa  242  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  41.69 
 
 		 317 aa  238  9e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  40.84 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  40.65 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  43.23 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  42.76 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  41.16 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  39.46 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  38.72 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  42.95 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  41.75 
 
 		 332 aa  231  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  40.07 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  44.26 
 
 		 317 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  41.28 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  39.6 
 
 		 311 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  43.67 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  37.74 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  40.13 
 
 		 318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  40.82 
 
 		 358 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 316 aa  225  7e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  43.24 
 
 		 314 aa  225  7e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  41.53 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  38.83 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  41.25 
 
 		 308 aa  222  6e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  40.13 
 
 		 318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  34.46 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  35.14 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  34.24 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  40.4 
 
 		 341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  38.48 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  39.53 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  35.14 
 
 		 310 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  38.03 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  36.27 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  35.96 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  32.93 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  37.34 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  37.58 
 
 		 324 aa  192  7e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  33.55 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  33.55 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  32.88 
 
 		 800 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  25 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  21.02 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  28.86 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 		 579 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.77 
 
 		 308 aa  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5883  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  25.16 
 
 		 459 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  21.78 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  26.71 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 360 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.14 
 
 		 296 aa  49.3  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11698  molybdopterin biosynthesis protein moeX  25.71 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.509473 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  28.08 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  21.83 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  25.38 
 
 		 422 aa  47.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  25 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  20.79 
 
 		 323 aa  47  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 330 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 330 aa  46.2  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 		 415 aa  46.6  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.19 
 
 		 353 aa  46.6  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  26.04 
 
 		 450 aa  46.2  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  29.29 
 
 		 327 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  24.8 
 
 		 397 aa  46.2  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  26.81 
 
 		 410 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  29.85 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  30.86 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0516  radical SAM domain-containing protein  37.7 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3487  Radical SAM domain protein  22.94 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  24.46 
 
 		 429 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  24.66 
 
 		 595 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  36.47 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  31.46 
 
 		 1014 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  28.75 
 
 		 368 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 380 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 412 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  20.74 
 
 		 468 aa  44.3  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  28.33 
 
 		 438 aa  43.5  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  29.1 
 
 		 418 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 396 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  20.44 
 
 		 482 aa  43.5  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.77 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.5 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  30.68 
 
 		 1000 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  22.44 
 
 		 317 aa  43.1  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  29.63 
 
 		 332 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  35.14 
 
 		 347 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  23.03 
 
 		 394 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>