More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1994 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 293 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  65.19 
 
 		 294 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3657  DNA protecting protein DprA  44.01 
 
 		 289 aa  242  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00245639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  42.81 
 
 		 291 aa  239  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3881  DNA processing Smf protein  42.96 
 
 		 289 aa  238  8e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000554633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3593  SMF family nucleotide-binding protein  43.31 
 
 		 289 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.46698  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3846  DNA processing Smf protein  43.66 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3575  SMF family nucleotide-binding protein  43.66 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00451445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  42.96 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3876  Smf family DNA processing protein  42.25 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000864886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1311  DNA processing Smf protein  42.25 
 
 		 289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  43.42 
 
 		 361 aa  205  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  41.55 
 
 		 374 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  46.22 
 
 		 370 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  47 
 
 		 364 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  36.75 
 
 		 409 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  47.35 
 
 		 349 aa  195  9e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  44.87 
 
 		 360 aa  195  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  46.73 
 
 		 363 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  47.79 
 
 		 406 aa  193  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  43.8 
 
 		 365 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  41.94 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  40.51 
 
 		 369 aa  192  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  47.14 
 
 		 373 aa  192  6e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  48.42 
 
 		 377 aa  192  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  46.48 
 
 		 394 aa  191  8e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  50.24 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  50.24 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  47.14 
 
 		 369 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  41.31 
 
 		 366 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  42.03 
 
 		 374 aa  189  5e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  47.35 
 
 		 373 aa  189  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  40.69 
 
 		 399 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  44.65 
 
 		 295 aa  188  9e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  49.3 
 
 		 352 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  46.67 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  43.98 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  50 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  40.71 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  44.26 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  40.07 
 
 		 371 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  40.31 
 
 		 358 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  44 
 
 		 362 aa  186  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  42.03 
 
 		 375 aa  185  7e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  45.82 
 
 		 338 aa  185  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  45.82 
 
 		 338 aa  185  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  43.61 
 
 		 383 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  40.55 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  44.44 
 
 		 360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  49.05 
 
 		 364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  45.24 
 
 		 338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  39.5 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  41.92 
 
 		 356 aa  183  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  48.34 
 
 		 368 aa  183  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  43.48 
 
 		 365 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  45.05 
 
 		 372 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  42.17 
 
 		 389 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  48.11 
 
 		 338 aa  182  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  46.45 
 
 		 364 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  45.18 
 
 		 281 aa  182  8.000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  39.06 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  48.11 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  43.7 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  44.09 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  43.7 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  43.7 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  48.1 
 
 		 401 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.46 
 
 		 362 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  38.82 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  41.27 
 
 		 364 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  49.27 
 
 		 339 aa  179  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  47.93 
 
 		 374 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  45.97 
 
 		 356 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  43.62 
 
 		 338 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  49.05 
 
 		 375 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  43.44 
 
 		 405 aa  179  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  46.45 
 
 		 331 aa  178  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  42.91 
 
 		 340 aa  178  9e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  47.62 
 
 		 402 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  47.62 
 
 		 401 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0778  DNA protecting protein DprA  45.97 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  47.2 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  43.66 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  45.91 
 
 		 399 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  47.64 
 
 		 296 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  47.17 
 
 		 359 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  46.67 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  44.39 
 
 		 429 aa  175  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  42.49 
 
 		 377 aa  175  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  46.7 
 
 		 359 aa  175  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  47.64 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  38.52 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  40.96 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1609  DNA protecting protein DprA  45.71 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.709828  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  46.67 
 
 		 362 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2865  DNA processing protein DprA, putative  49.75 
 
 		 371 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  44.54 
 
 		 408 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  48.54 
 
 		 377 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  46.67 
 
 		 336 aa  172  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  40.89 
 
 		 375 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>