More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0421 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
381 aa  750    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  62.8 
 
 
377 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3009  major facilitator transporter  47.61 
 
 
398 aa  350  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3319  major facilitator family transporter  48.88 
 
 
398 aa  347  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3097  major facilitator family transporter  48.88 
 
 
398 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2994  multidrug-efflux protein  48.88 
 
 
398 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0565692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3342  major facilitator family transporter  48.88 
 
 
398 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3305  major facilitator family transporter  48.88 
 
 
398 aa  346  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3301  major facilitator family transporter  47.45 
 
 
398 aa  345  6e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.47989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1931  major facilitator family transporter  47.45 
 
 
398 aa  345  7e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248992  normal  0.489615 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3311  major facilitator family transporter  48.6 
 
 
398 aa  345  8e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  48.6 
 
 
398 aa  344  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2102  major facilitator transporter  46.63 
 
 
398 aa  334  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  29.61 
 
 
394 aa  146  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 
394 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 
394 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  28.38 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  28.93 
 
 
394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 
389 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3989  major facilitator transporter  27.27 
 
 
410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
389 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  27.48 
 
 
388 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
397 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  24.65 
 
 
413 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  29.08 
 
 
375 aa  116  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  27.17 
 
 
382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  27.81 
 
 
395 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  27.42 
 
 
380 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
388 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  25.8 
 
 
376 aa  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  26.63 
 
 
380 aa  103  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  27.2 
 
 
380 aa  102  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  24.4 
 
 
388 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3194  major facilitator transporter  23.97 
 
 
388 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4752  major facilitator transporter  25.99 
 
 
388 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 
402 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  24.93 
 
 
386 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  25.57 
 
 
392 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  25.76 
 
 
387 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  25.82 
 
 
381 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  25.95 
 
 
379 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  25.48 
 
 
387 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  26.37 
 
 
379 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  26.37 
 
 
379 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  25.56 
 
 
379 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  26.11 
 
 
393 aa  92  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  22.79 
 
 
392 aa  92  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  23.24 
 
 
385 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
389 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 
386 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  26.01 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 
418 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4799  major facilitator transporter  22.64 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  24.86 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  26.3 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  25.14 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  25.14 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  25.14 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  24.32 
 
 
429 aa  82.8  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  24.72 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  22.57 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0452  major facilitator transporter  25.38 
 
 
390 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3577  major facilitator transporter  25.38 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  25.98 
 
 
412 aa  82  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  25.27 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  20.77 
 
 
418 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  24.31 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  25.27 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0448  major facilitator transporter  25.08 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  26.01 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  25.63 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  25.88 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  24.05 
 
 
444 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  24.01 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  24.01 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  24.01 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  23.45 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  24.8 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  24.01 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  24.01 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  24.01 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  25.88 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  24.54 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  21.02 
 
 
424 aa  77.4  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  25.47 
 
 
432 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  23.45 
 
 
429 aa  77  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  25.34 
 
 
386 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  21.37 
 
 
416 aa  76.3  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 
454 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  25.44 
 
 
411 aa  75.9  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0228  hypothetical protein  24.71 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  24.13 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  22.79 
 
 
430 aa  72.8  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2386  major facilitator superfamily MFS_1  22.6 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  23.2 
 
 
428 aa  72.8  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  23.96 
 
 
421 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.52 
 
 
440 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>