152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1256 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  427  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  42.31 
 
 		 425 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  36.17 
 
 		 327 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  36.17 
 
 		 327 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  37.31 
 
 		 363 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  39.87 
 
 		 356 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  38.37 
 
 		 327 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  41.14 
 
 		 228 aa  121  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  35.75 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  39.58 
 
 		 340 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 218 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  31.77 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  35.23 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 218 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  34.39 
 
 		 221 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  34.64 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  34.64 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  37.14 
 
 		 218 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  33.76 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1255  hypothetical protein  35.08 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.847765  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  32.8 
 
 		 198 aa  95.5  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  30.46 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  31.36 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  30.51 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  30.51 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  30.51 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  30.51 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  30.51 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  30.51 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  30.51 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  28.79 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  29.77 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1570  hypothetical protein  33.71 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  34.34 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  33.65 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  36.84 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1366  hypothetical protein  32.58 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0508  hypothetical protein  32.58 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.588285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1595  hypothetical protein  32.58 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0258875  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0648  hypothetical protein  32.58 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0599933  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  34.38 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1756  hypothetical protein  32.58 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  33.98 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  35.96 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1066  hypothetical protein  29.27 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.172468  normal  0.032179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  28.97 
 
 		 241 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  31.43 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  27.27 
 
 		 310 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  28.31 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  28.37 
 
 		 248 aa  52.4  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  29.41 
 
 		 240 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  26.27 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  29.38 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  28.24 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  34.04 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  39 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  35.71 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  32.99 
 
 		 444 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  34.04 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  34.04 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  34.04 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  34.04 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  34.04 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  38.96 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1776  electron transport protein SCO1/SenC  29.03 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254998  normal  0.31988 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  34.04 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  30.72 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  35.79 
 
 		 188 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  34.04 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  39.22 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  29.82 
 
 		 286 aa  48.9  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  29.19 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0582  electron transport protein SCO1/SenC  35.42 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  34.38 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  34.38 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  39.53 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  31.58 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  36.59 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  36.59 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  36.59 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  28.81 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  34.69 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2780  electron transport protein SCO1/SenC  35.05 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.668811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  31.37 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  28.46 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  31.31 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  31.03 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  27.75 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  31.71 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  28.26 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  32.35 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  31.34 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  31.91 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0976  major antigenic protein  25.64 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  29.03 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>