More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2619 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  70.13 
 
 		 701 aa  938    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 698 aa  1404    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  57.89 
 
 		 686 aa  731    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  71.47 
 
 		 702 aa  946    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  53.21 
 
 		 709 aa  728    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  62.54 
 
 		 708 aa  831    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  56.65 
 
 		 682 aa  723    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  63.91 
 
 		 709 aa  839    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  71.17 
 
 		 712 aa  970    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  52.99 
 
 		 724 aa  675    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  63.68 
 
 		 697 aa  841    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  93.68 
 
 		 696 aa  1246    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  57.8 
 
 		 702 aa  758    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  64.59 
 
 		 707 aa  865    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  50.43 
 
 		 708 aa  680    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  50.52 
 
 		 693 aa  631  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  49.36 
 
 		 694 aa  631  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  46.73 
 
 		 688 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  45.92 
 
 		 652 aa  562  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7839  CheA signal transduction histidine kinase  46.36 
 
 		 691 aa  561  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  44.67 
 
 		 686 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  45.26 
 
 		 681 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  46.16 
 
 		 679 aa  555  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 679 aa  544  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  43.98 
 
 		 685 aa  538  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 		 732 aa  520  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  39.86 
 
 		 720 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  40.16 
 
 		 741 aa  501  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 654 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  40.68 
 
 		 700 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  37.55 
 
 		 733 aa  484  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  40.63 
 
 		 705 aa  482  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0578  chemotaxis histidine kinase  37.95 
 
 		 714 aa  480  1e-134  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 699 aa  474  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1317  CheA signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 		 733 aa  466  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460815  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 686 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  39.02 
 
 		 720 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 707 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 695 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 677 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1209  CheA signal transduction histidine kinases  38.48 
 
 		 697 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 682 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 739 aa  435  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 688 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 756 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 759 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2478  CheA signal transduction histidine kinase  57.61 
 
 		 660 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54146  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 747 aa  422  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2574  CheA signal transduction histidine kinase  57.34 
 
 		 661 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.12503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1379  CheA signal transduction histidine kinase  57.07 
 
 		 658 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0851844  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0298  CheA signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 763 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265941  normal  0.326442 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 758 aa  412  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 684 aa  405  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 684 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  36.38 
 
 		 703 aa  392  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.28 
 
 		 691 aa  392  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  37.16 
 
 		 662 aa  392  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  37.5 
 
 		 669 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.47 
 
 		 806 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  36.88 
 
 		 681 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  36.62 
 
 		 654 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 654 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  36.48 
 
 		 654 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  36.62 
 
 		 654 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  36.62 
 
 		 652 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  36.62 
 
 		 652 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  36.62 
 
 		 654 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  36.62 
 
 		 654 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 735 aa  388  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 675 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  37.15 
 
 		 674 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 702 aa  384  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 666 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5775  CheA signal transduction histidine kinase  53.68 
 
 		 714 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  36.76 
 
 		 654 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4815  CheA signal transduction histidine kinase  53.68 
 
 		 702 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391755 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 681 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0619  CheA signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 794 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110186 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 713 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  35.09 
 
 		 684 aa  379  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 660 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.52 
 
 		 677 aa  379  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  36.1 
 
 		 717 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  34.86 
 
 		 711 aa  372  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  36.24 
 
 		 727 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  36.5 
 
 		 717 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1584  chemotaxis histidine protein kinase  51.45 
 
 		 654 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.678464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0236  CheA signal transduction histidine kinases  51.19 
 
 		 654 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  35.88 
 
 		 758 aa  363  8e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 687 aa  362  9e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  31.56 
 
 		 692 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 751 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 655 aa  356  8.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4077  Chemotaxis protein histidine kinase  37.65 
 
 		 662 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  47.09 
 
 		 732 aa  352  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  32.62 
 
 		 667 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  32.62 
 
 		 667 aa  351  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 		 725 aa  351  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  31.99 
 
 		 670 aa  349  9e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  32.58 
 
 		 667 aa  349  9e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>