More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2250 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2250  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 178 aa  358  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1967  heat shock protein Hsp20  96.63 
 
 		 178 aa  348  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  52 
 
 		 153 aa  131  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  45.21 
 
 		 195 aa  124  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2863  heat shock protein Hsp20  45.99 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  40.43 
 
 		 151 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  38.78 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  36.55 
 
 		 169 aa  98.2  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  48.39 
 
 		 148 aa  97.1  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  38.93 
 
 		 173 aa  97.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  45.19 
 
 		 142 aa  94  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  38.46 
 
 		 149 aa  94  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 		 147 aa  90.9  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  32.4 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 		 143 aa  88.6  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3061  heat shock protein Hsp20  33.88 
 
 		 158 aa  87.8  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  35.97 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 		 153 aa  87  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3063  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 		 189 aa  85.1  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 		 145 aa  84.3  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 		 189 aa  84.3  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 		 156 aa  84  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  36.23 
 
 		 145 aa  84  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  34.25 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  43.18 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  32.86 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2898  heat shock protein Hsp20  37.69 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.828136  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3064  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  35.46 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  31.47 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  30.15 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  30.15 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0154  heat shock protein Hsp20  37.4 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  37.69 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  35.56 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  36.29 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  40.78 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  32.86 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  39.42 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  31.4 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1333  heat shock protein Hsp20  41.07 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  32.12 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2210  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0417447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  32.86 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  31.11 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3074  heat shock protein Hsp20  34.35 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  38.76 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  36.67 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1347  heat shock protein Hsp20  38.14 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.452932  normal  0.819182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0343  heat shock protein Hsp20  30 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.90555e-28 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  33.57 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1648  heat shock protein, Hsp20 family  38.14 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0675  heat shock protein Hsp20  39.01 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000000558694  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1122  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.421321  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  35.16 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  40.22 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  39.25 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  40.21 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  40.78 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2505  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.239492  normal  0.0462479 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  33.04 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  29.23 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  41.57 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  35.16 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  30.43 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  30 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  35.92 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  28.26 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  33.06 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  29.32 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1986  heat shock protein Hsp20  40.62 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  37.62 
 
 		 144 aa  73.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3076  heat shock protein Hsp20  32.04 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  30.15 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  30.97 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1651  heat shock protein Hsp20  38.14 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000431905  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3312  heat shock protein, putative  39 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0630  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3725  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.843054  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  34.68 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0599  heat shock protein Hsp20  35.05 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.187967  normal  0.122676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  34.06 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  30.88 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  29.66 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  30 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>