More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1682 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 589 aa  1205    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  95.25 
 
 		 589 aa  1160    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  47.71 
 
 		 581 aa  619  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  49.75 
 
 		 576 aa  593  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  45.47 
 
 		 596 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  45.36 
 
 		 574 aa  467  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  40.88 
 
 		 596 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  41.74 
 
 		 565 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  39.4 
 
 		 596 aa  443  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  38.41 
 
 		 598 aa  415  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  36.86 
 
 		 595 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  36.9 
 
 		 604 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  34.77 
 
 		 599 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0896  Rhs element Vgr protein  28.86 
 
 		 545 aa  232  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1040  Rhs element Vgr protein  28.86 
 
 		 545 aa  232  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.605907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  26.46 
 
 		 589 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  24.54 
 
 		 593 aa  144  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  28.14 
 
 		 610 aa  139  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  24.01 
 
 		 592 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  24.77 
 
 		 602 aa  121  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  24 
 
 		 641 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  25.76 
 
 		 578 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  25.22 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  37.95 
 
 		 218 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  25.21 
 
 		 599 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  26.71 
 
 		 587 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  25.6 
 
 		 594 aa  100  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  24.77 
 
 		 606 aa  100  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  22.84 
 
 		 605 aa  98.6  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  32.66 
 
 		 229 aa  97.1  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  29.36 
 
 		 248 aa  96.7  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  22.9 
 
 		 617 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  28.85 
 
 		 599 aa  89  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  25.8 
 
 		 576 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  31.19 
 
 		 239 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  30.25 
 
 		 226 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  36.09 
 
 		 212 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  28.19 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  27.67 
 
 		 602 aa  81.3  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  24.68 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  29.61 
 
 		 611 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  32.6 
 
 		 245 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  24.57 
 
 		 348 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  22.92 
 
 		 619 aa  77.4  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  22.5 
 
 		 499 aa  77  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  22.59 
 
 		 612 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  28.95 
 
 		 618 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  23.66 
 
 		 652 aa  75.1  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  27.75 
 
 		 616 aa  74.7  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  26.84 
 
 		 275 aa  73.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  28.76 
 
 		 615 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  26.16 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  25.66 
 
 		 697 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  30.23 
 
 		 602 aa  67.8  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3220  Rhs element Vgr protein  22.52 
 
 		 618 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  26.03 
 
 		 1017 aa  65.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  26.72 
 
 		 741 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  23.44 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  23.89 
 
 		 724 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  24.58 
 
 		 1057 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1883  Phage protein D-like  24.38 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  21.27 
 
 		 777 aa  64.3  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  23.3 
 
 		 741 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  25.9 
 
 		 741 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  25.38 
 
 		 753 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  26.67 
 
 		 735 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1538  two component LuxR family transcriptional regulator  21.84 
 
 		 621 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  23.08 
 
 		 714 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  22.78 
 
 		 687 aa  62.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  22.78 
 
 		 687 aa  62.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  22.78 
 
 		 687 aa  62.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  23.99 
 
 		 641 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  23.27 
 
 		 689 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  22.85 
 
 		 794 aa  61.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  23.65 
 
 		 646 aa  60.5  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  23.61 
 
 		 872 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2758  vgrG protein  23.31 
 
 		 774 aa  60.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  22.86 
 
 		 896 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  22.86 
 
 		 858 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0153  Rhs element Vgr protein  25.42 
 
 		 689 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  22.79 
 
 		 780 aa  59.7  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  24.02 
 
 		 709 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  22.86 
 
 		 661 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  22.86 
 
 		 930 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  24.83 
 
 		 706 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0938  Phage protein D-like  24.71 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367858  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  22.43 
 
 		 689 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1954  Phage protein D-like protein  20.63 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  22.18 
 
 		 796 aa  58.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0770  Phage protein D-like protein  20.81 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7557  vgrG protein  21.92 
 
 		 653 aa  58.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7056  vgrG protein  21.87 
 
 		 741 aa  58.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0833871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  24.26 
 
 		 655 aa  57.8  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  23.61 
 
 		 616 aa  57.4  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0853  hypothetical protein  31.82 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  22.01 
 
 		 643 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3392  vgrG protein  21.98 
 
 		 695 aa  57  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.92482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  25 
 
 		 808 aa  57  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  22.22 
 
 		 661 aa  57  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  26.39 
 
 		 614 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>