More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1302 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2923  histidine kinase  94.82 
 
 		 598 aa  1113    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  64.44 
 
 		 590 aa  700    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  61.71 
 
 		 608 aa  673    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.37 
 
 		 584 aa  687    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.71 
 
 		 609 aa  677    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  73.58 
 
 		 604 aa  878    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  100 
 
 		 596 aa  1221    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1802  histidine kinase  60.26 
 
 		 540 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.963501  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1728  histidine kinase  59.93 
 
 		 560 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1854  histidine kinase  56.86 
 
 		 578 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  56.96 
 
 		 578 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2102  histidine kinase  57.56 
 
 		 575 aa  628  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.03 
 
 		 584 aa  622  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4130  histidine kinase  55.56 
 
 		 572 aa  621  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.964997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.85 
 
 		 620 aa  615  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.838333  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4039  histidine kinase  56.01 
 
 		 572 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  56.09 
 
 		 596 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  56.09 
 
 		 597 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  55.72 
 
 		 599 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1907  histidine kinase  45.19 
 
 		 560 aa  488  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.649995 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1761  histidine kinase  42.46 
 
 		 578 aa  476  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  48.87 
 
 		 779 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  46.24 
 
 		 774 aa  237  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1249  sensory box histidine kinase  44.44 
 
 		 524 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0948878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.32 
 
 		 986 aa  233  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 		 406 aa  231  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 771 aa  229  9e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1894  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.17 
 
 		 1085 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 		 780 aa  226  9e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2003  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 		 653 aa  225  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.977312  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1055 aa  223  6e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 536 aa  212  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000503711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  40.96 
 
 		 917 aa  211  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3266  putative PAS/PAC sensor protein  43.53 
 
 		 830 aa  206  8e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1832  histidine kinase  41.06 
 
 		 550 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156636 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2643  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 552 aa  193  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1960  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 525 aa  186  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 528 aa  165  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2950  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 710 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3113  histidine kinase  37.8 
 
 		 654 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000907022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2388  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 552 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.245714  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 		 1047 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 552 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  27.59 
 
 		 576 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 1047 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 683 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  36.96 
 
 		 505 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 392 aa  151  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3777  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 701 aa  151  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215477  hitchhiker  0.0067097 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3689  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 655 aa  151  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 588 aa  150  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1953  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 458 aa  150  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 713 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2797  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 480 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 492 aa  147  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 553 aa  147  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3878  histidine kinase  33.91 
 
 		 692 aa  146  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.245936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  35.53 
 
 		 310 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4122  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 449 aa  145  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2233  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 552 aa  144  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0296242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  34.51 
 
 		 305 aa  143  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2960  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 557 aa  143  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  34.63 
 
 		 524 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 566 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  33.68 
 
 		 627 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  33.68 
 
 		 627 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 695 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  33.68 
 
 		 627 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 557 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  33.68 
 
 		 627 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  33.68 
 
 		 627 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  33.68 
 
 		 627 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  33.68 
 
 		 627 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.38 
 
 		 541 aa  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 611 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 611 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0721  histidine kinase  33.82 
 
 		 675 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 683 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 507 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  34.6 
 
 		 626 aa  139  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2667  histidine kinase  39.01 
 
 		 486 aa  139  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  32.86 
 
 		 1187 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  32.99 
 
 		 408 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  32.99 
 
 		 408 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1987  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 552 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 470 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  34.83 
 
 		 611 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 448 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  29.94 
 
 		 785 aa  137  7.000000000000001e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  36.05 
 
 		 659 aa  136  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 589 aa  136  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 597 aa  136  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0801303  normal  0.115737 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0344  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 459 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337335  normal  0.899671 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 785 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 919 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 602 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 675 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>