58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5775 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  49.09 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  39.07 
 
 		 276 aa  142  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  38.53 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 246 aa  131  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  34.09 
 
 		 230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  33.48 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  34.42 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 		 216 aa  99  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 236 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 247 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 247 aa  91.7  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  31.08 
 
 		 241 aa  91.7  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 244 aa  90.1  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 261 aa  85.1  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  32.2 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  31.58 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  37.01 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  22.81 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  20.21 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  23.61 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  23.32 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 248 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  24.35 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  21.67 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>