85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5531 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  801    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  54.5 
 
 		 402 aa  431  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2969  protein of unknown function DUF262  48.82 
 
 		 392 aa  346  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.901235  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  46.15 
 
 		 390 aa  330  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  32.96 
 
 		 399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  27.51 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  27.39 
 
 		 377 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  28.15 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  27.47 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  28.45 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  25.79 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  27.99 
 
 		 470 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  27.38 
 
 		 345 aa  99.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  27.7 
 
 		 349 aa  99.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  30 
 
 		 409 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  26.47 
 
 		 389 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  31.17 
 
 		 375 aa  90.1  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  31.17 
 
 		 375 aa  90.1  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  27.56 
 
 		 370 aa  89.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  26.01 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  26.32 
 
 		 617 aa  83.2  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  28.98 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  27.16 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  31.18 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  28.73 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  23.88 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  26.19 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  23.91 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  26.19 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  24.48 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  27.35 
 
 		 548 aa  72  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  26.41 
 
 		 705 aa  71.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  27.23 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  23.16 
 
 		 539 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  30.23 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  23.42 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  25.51 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  25.39 
 
 		 638 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  22.56 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  26.32 
 
 		 555 aa  67.8  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  25.11 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  28.77 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  28.57 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  24.9 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  27.19 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  30.81 
 
 		 650 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  27.14 
 
 		 221 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  27.14 
 
 		 221 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  37.66 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  22.69 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  24.16 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  24.59 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  32.95 
 
 		 760 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  21.67 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  23.84 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  40 
 
 		 390 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  27.18 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  24.52 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  21.76 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  23.46 
 
 		 344 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4280  hypothetical protein  40 
 
 		 388 aa  53.5  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  24.09 
 
 		 657 aa  53.5  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  28.02 
 
 		 589 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  25.98 
 
 		 753 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  22.75 
 
 		 764 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  31.4 
 
 		 584 aa  50.8  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  27.1 
 
 		 598 aa  50.4  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  31.03 
 
 		 754 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  31.03 
 
 		 754 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  30.63 
 
 		 617 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  29.13 
 
 		 570 aa  49.7  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  24.53 
 
 		 588 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  22.58 
 
 		 522 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  28.45 
 
 		 615 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  21.78 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  22.94 
 
 		 640 aa  46.6  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  22.13 
 
 		 641 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  30.16 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  27.85 
 
 		 593 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  25.42 
 
 		 687 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  36.11 
 
 		 578 aa  43.9  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  25.61 
 
 		 756 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  24.32 
 
 		 588 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  24.73 
 
 		 589 aa  43.1  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  24.49 
 
 		 778 aa  42.7  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>