171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2756 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  100 
 
 		 618 aa  1258    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  54.81 
 
 		 584 aa  653    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  32.4 
 
 		 470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  29.74 
 
 		 413 aa  134  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  32.58 
 
 		 461 aa  134  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  30.26 
 
 		 491 aa  133  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  35.46 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  33.24 
 
 		 455 aa  132  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  33.43 
 
 		 449 aa  131  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  32.59 
 
 		 444 aa  127  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  30.9 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  32.38 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  32.38 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  29.15 
 
 		 495 aa  124  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  31.53 
 
 		 444 aa  123  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  30.58 
 
 		 480 aa  121  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  30.3 
 
 		 444 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  27.35 
 
 		 587 aa  118  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  29.65 
 
 		 441 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  32.28 
 
 		 445 aa  115  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  30.57 
 
 		 507 aa  114  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  31.44 
 
 		 647 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  29.39 
 
 		 480 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  29.39 
 
 		 480 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  29.39 
 
 		 480 aa  110  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  29.68 
 
 		 480 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  28.79 
 
 		 424 aa  107  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  30.21 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  28.93 
 
 		 417 aa  99.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  28.68 
 
 		 424 aa  95.9  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  30.69 
 
 		 415 aa  95.5  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  30.62 
 
 		 415 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  27.65 
 
 		 419 aa  94  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  27.65 
 
 		 419 aa  94  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 429 aa  93.6  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  30.06 
 
 		 415 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  30.41 
 
 		 415 aa  90.9  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  28.61 
 
 		 435 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  27.89 
 
 		 429 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 413 aa  89  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  25.52 
 
 		 409 aa  89  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  28.01 
 
 		 429 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 		 566 aa  87.8  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  28.34 
 
 		 435 aa  87.8  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 566 aa  87.4  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  27.92 
 
 		 406 aa  87  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  26.5 
 
 		 413 aa  87  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  27.56 
 
 		 429 aa  87  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1117  PrnC  26.44 
 
 		 566 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 566 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  27.56 
 
 		 429 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 566 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  28.23 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  29.18 
 
 		 416 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  27.35 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  28.61 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2887  halogenase PrnC  26.18 
 
 		 566 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.939862  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2735  halogenase PrnC  26.18 
 
 		 566 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  28.28 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  25.85 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  28.87 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  29.73 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  26.61 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  26.55 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  26.34 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  24.82 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  27.5 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  27.66 
 
 		 416 aa  80.1  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  25.7 
 
 		 415 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  25.82 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  28.21 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  26.85 
 
 		 476 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  27.62 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  24.6 
 
 		 384 aa  73.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  25.93 
 
 		 482 aa  72  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  32.53 
 
 		 473 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  32.53 
 
 		 473 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  32.53 
 
 		 473 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  31.76 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  25.51 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 417 aa  67  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  31.18 
 
 		 515 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  25.78 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  31.36 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  32.95 
 
 		 488 aa  65.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 563 aa  64.3  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  23.45 
 
 		 375 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  29.05 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  23.65 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  28.31 
 
 		 477 aa  60.1  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  28.74 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  29.05 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  23.73 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  27.63 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  30.93 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>