More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2621 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1474  ABC transporter related  51.15 
 
 		 758 aa  766    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.891231  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2074  ABC transporter related  71.54 
 
 		 798 aa  1159    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012346  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0595  daunorubicin resistance protein DrrC, putative  42.44 
 
 		 752 aa  656    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0588759  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28420  Excinuclease ATPase subunit  79.35 
 
 		 799 aa  1263    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0264  ABC transporter related  47.69 
 
 		 761 aa  683    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3727  ABC transporter related  79.21 
 
 		 810 aa  1284    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  53.38 
 
 		 790 aa  760    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01950  Excinuclease ATPase subunit  57.92 
 
 		 798 aa  898    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3170  ABC transporter related  78.75 
 
 		 801 aa  1232    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2761  ABC transporter related protein  50.7 
 
 		 752 aa  730    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  51.02 
 
 		 750 aa  758    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2061  ABC transporter related protein  65.49 
 
 		 756 aa  998    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2478  ABC transporter related  76.78 
 
 		 797 aa  1226    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.704947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1286  ABC transporter related protein  78.85 
 
 		 827 aa  1288    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19653  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0057  ABC transporter related  80.79 
 
 		 797 aa  1280    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0413721  normal  0.79813 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1980  ABC transporter related  49.05 
 
 		 753 aa  790    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2621  ABC transporter related  100 
 
 		 826 aa  1671    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.12429 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2501  ABC transporter related protein  76.99 
 
 		 805 aa  1247    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  81.12 
 
 		 790 aa  1305    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3212  ABC transporter related protein  79.95 
 
 		 790 aa  1285    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125335  hitchhiker  0.000000125221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1738  ABC transporter related  77.43 
 
 		 793 aa  1203    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  79.07 
 
 		 794 aa  1289    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0108  ABC transporter related  73.84 
 
 		 796 aa  1211    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2899  ABC transporter related  77.93 
 
 		 796 aa  1225    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000977115  hitchhiker  0.0000331786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1706  ABC transporter related protein  80.03 
 
 		 795 aa  1271    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1999  ABC transporter related  47.01 
 
 		 761 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0727  ABC transporter related protein  51.66 
 
 		 752 aa  689    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3531  ABC transporter related  70.56 
 
 		 754 aa  1106    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114059  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3040  ABC transporter related  44.66 
 
 		 754 aa  657    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0889  excinuclease ATPase subunit  43.97 
 
 		 760 aa  676    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.470006  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2219  ABC transporter related protein  77.09 
 
 		 788 aa  1225    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2199  ABC transporter related  78.14 
 
 		 794 aa  1266    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424891  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1716  ABC transporter related  50 
 
 		 745 aa  765    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1801  ABC transporter related  46.82 
 
 		 745 aa  737    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.344909  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1760  ABC transporter related protein  70.31 
 
 		 799 aa  1115    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144756  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2679  ABC transporter related  76.5 
 
 		 795 aa  1221    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.249669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1785  ABC transporter related  77.43 
 
 		 793 aa  1203    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.806156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4179  ABC transporter related  83.62 
 
 		 795 aa  1338    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706824  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3006  ABC transporter-related protein  74.72 
 
 		 792 aa  1178    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320548  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  78.02 
 
 		 792 aa  1285    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7895  excinuclease ABC subunit A  84.25 
 
 		 768 aa  1333    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3201  ABC transporter related protein  79.32 
 
 		 790 aa  1244    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0977104  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1600  ABC transporter related protein  78.2 
 
 		 798 aa  1276    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.239381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5797  ABC transporter related protein  49.75 
 
 		 780 aa  768    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.68212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2335  ABC transporter related  77.29 
 
 		 797 aa  1259    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0125219 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0097  ABC transporter related  72.45 
 
 		 792 aa  1175    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73348  normal  0.128909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  50.64 
 
 		 751 aa  788    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1717  ABC transporter related  77.3 
 
 		 793 aa  1199    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18400  Excinuclease ATPase subunit  80.43 
 
 		 795 aa  1273    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3513  ABC transporter related protein  39.85 
 
 		 752 aa  614  9.999999999999999e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0485409  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1560  putative excision nuclease ABC subunit  74.93 
 
 		 402 aa  592  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.228081  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0885  excinuclease ATPase subunit  40.94 
 
 		 750 aa  592  1e-167  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.987216  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  37.4 
 
 		 850 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  37.76 
 
 		 844 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  35.82 
 
 		 843 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  35.96 
 
 		 823 aa  475  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  35.82 
 
 		 950 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  35.43 
 
 		 897 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  34.81 
 
 		 820 aa  465  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  37.82 
 
 		 827 aa  465  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  37.85 
 
 		 848 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  36.43 
 
 		 861 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  35.87 
 
 		 853 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  37.73 
 
 		 848 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  37.73 
 
 		 848 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  36.12 
 
 		 838 aa  459  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  36.15 
 
 		 838 aa  459  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  35.74 
 
 		 838 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  37.44 
 
 		 843 aa  452  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  39.28 
 
 		 776 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1559  putative uvrA-like protein  86.9 
 
 		 253 aa  450  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0605734  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  34.93 
 
 		 877 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  37.16 
 
 		 860 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  37.31 
 
 		 863 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  36.06 
 
 		 894 aa  445  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  35.71 
 
 		 822 aa  446  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  35.86 
 
 		 832 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  39.49 
 
 		 947 aa  441  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  37.91 
 
 		 927 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  33.45 
 
 		 834 aa  438  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  35.22 
 
 		 885 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  35.38 
 
 		 898 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  35.63 
 
 		 838 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0110  excinuclease ABC, A subunit  36.65 
 
 		 2017 aa  435  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1256  excinuclease ABC, A subunit  42.49 
 
 		 966 aa  436  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1187  excinuclease ABC, A subunit  42.19 
 
 		 965 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1792  excinuclease ABC, A subunit  38.06 
 
 		 824 aa  435  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  35.49 
 
 		 898 aa  436  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  38.16 
 
 		 942 aa  430  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1104  excinuclease ABC subunit A  37.56 
 
 		 939 aa  430  1e-119  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  37.47 
 
 		 845 aa  432  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  38.81 
 
 		 833 aa  432  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  38.31 
 
 		 946 aa  429  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  40.89 
 
 		 946 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  41.89 
 
 		 966 aa  429  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  39.15 
 
 		 946 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  39.8 
 
 		 916 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  40.8 
 
 		 963 aa  429  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2732  excinuclease ABC, A subunit  41.65 
 
 		 962 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.102392  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  37.09 
 
 		 939 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>