More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1559 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1559  putative uvrA-like protein  100 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0605734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7895  excinuclease ABC subunit A  88.89 
 
 		 768 aa  457  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2621  ABC transporter related  86.9 
 
 		 826 aa  450  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.12429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4179  ABC transporter related  84.92 
 
 		 795 aa  448  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706824  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2899  ABC transporter related  82.94 
 
 		 796 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000977115  hitchhiker  0.0000331786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  85.38 
 
 		 792 aa  443  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1706  ABC transporter related protein  83 
 
 		 795 aa  440  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18400  Excinuclease ATPase subunit  82.87 
 
 		 795 aa  437  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3170  ABC transporter related  82.61 
 
 		 801 aa  438  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2501  ABC transporter related protein  84.19 
 
 		 805 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0057  ABC transporter related  83.4 
 
 		 797 aa  434  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0413721  normal  0.79813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3212  ABC transporter related protein  82.47 
 
 		 790 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125335  hitchhiker  0.000000125221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  82.21 
 
 		 790 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1738  ABC transporter related  81.25 
 
 		 793 aa  427  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2199  ABC transporter related  81.82 
 
 		 794 aa  428  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424891  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3727  ABC transporter related  82.07 
 
 		 810 aa  427  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1785  ABC transporter related  81.25 
 
 		 793 aa  427  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.806156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  81.03 
 
 		 794 aa  427  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1717  ABC transporter related  81.25 
 
 		 793 aa  425  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28420  Excinuclease ATPase subunit  81.35 
 
 		 799 aa  424  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1286  ABC transporter related protein  81.42 
 
 		 827 aa  426  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19653  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2219  ABC transporter related protein  79.68 
 
 		 788 aa  421  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0108  ABC transporter related  79.6 
 
 		 796 aa  420  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2478  ABC transporter related  80 
 
 		 797 aa  418  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.704947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2335  ABC transporter related  80.08 
 
 		 797 aa  420  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0125219 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3201  ABC transporter related protein  83 
 
 		 790 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0977104  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2679  ABC transporter related  79.68 
 
 		 795 aa  414  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.249669  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1600  ABC transporter related protein  78.91 
 
 		 798 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.239381 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2074  ABC transporter related  77.08 
 
 		 798 aa  408  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012346  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3006  ABC transporter-related protein  74.9 
 
 		 792 aa  400  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320548  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1760  ABC transporter related protein  78.17 
 
 		 799 aa  393  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144756  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0097  ABC transporter related  75 
 
 		 792 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73348  normal  0.128909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3531  ABC transporter related  75.4 
 
 		 754 aa  388  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114059  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2061  ABC transporter related protein  72.91 
 
 		 756 aa  348  4e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  58.94 
 
 		 751 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  58.13 
 
 		 750 aa  298  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01950  Excinuclease ATPase subunit  61.07 
 
 		 798 aa  296  3e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5797  ABC transporter related protein  55.35 
 
 		 780 aa  294  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.68212 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1980  ABC transporter related  54 
 
 		 753 aa  291  8e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1474  ABC transporter related  59.27 
 
 		 758 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.891231  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1716  ABC transporter related  52.85 
 
 		 745 aa  283  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  59.27 
 
 		 790 aa  279  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2761  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 752 aa  276  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1801  ABC transporter related  51.22 
 
 		 745 aa  268  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.344909  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0727  ABC transporter related protein  54.84 
 
 		 752 aa  264  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0889  excinuclease ATPase subunit  47.56 
 
 		 760 aa  253  2.0000000000000002e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.470006  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0595  daunorubicin resistance protein DrrC, putative  45.63 
 
 		 752 aa  250  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0588759  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0885  excinuclease ATPase subunit  46.56 
 
 		 750 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.987216  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0168  excinuclease ABC subunit A  46.48 
 
 		 921 aa  240  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1187  excinuclease ABC, A subunit  49.42 
 
 		 965 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  48.45 
 
 		 944 aa  239  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1256  excinuclease ABC, A subunit  49.03 
 
 		 966 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145328  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1127  excinuclease ABC subunit A  49.03 
 
 		 966 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0264  ABC transporter related  50 
 
 		 761 aa  235  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  48.05 
 
 		 947 aa  235  6e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  48.44 
 
 		 927 aa  235  7e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  46.3 
 
 		 942 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  47.89 
 
 		 946 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1104  excinuclease ABC subunit A  46.15 
 
 		 939 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  48.05 
 
 		 987 aa  233  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  48.44 
 
 		 946 aa  232  5e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3040  ABC transporter related  48.4 
 
 		 754 aa  231  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  47.51 
 
 		 941 aa  230  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  48.06 
 
 		 942 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  45.77 
 
 		 939 aa  230  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  47.29 
 
 		 942 aa  230  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  46.48 
 
 		 954 aa  230  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  47.66 
 
 		 987 aa  230  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  44.96 
 
 		 956 aa  229  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  46.88 
 
 		 955 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  47.69 
 
 		 843 aa  229  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  45.38 
 
 		 939 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  46.88 
 
 		 946 aa  228  7e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  49.42 
 
 		 971 aa  227  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1170  excinuclease ABC, A subunit  47.86 
 
 		 973 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  47.29 
 
 		 916 aa  227  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2823  excinuclease ABC, A subunit  46.09 
 
 		 980 aa  227  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179729  normal  0.122251 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1194  excinuclease ABC subunit A  46.27 
 
 		 932 aa  226  2e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  47.27 
 
 		 956 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0120  excinuclease ABC subunit A  46.9 
 
 		 948 aa  227  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.973474  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3028  excinuclease ABC, A subunit  48.87 
 
 		 1976 aa  226  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  44.96 
 
 		 958 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5271  excinuclease ABC subunit A  44.96 
 
 		 958 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  44.96 
 
 		 958 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  44.96 
 
 		 958 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  44.96 
 
 		 958 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5285  excinuclease ABC subunit A  44.96 
 
 		 958 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2585  excinuclease ABC subunit A  47.47 
 
 		 979 aa  226  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.771268  normal  0.888283 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  44.96 
 
 		 958 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5672  excinuclease ABC subunit A  44.96 
 
 		 958 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  47.27 
 
 		 963 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4958  excinuclease ABC subunit A  45.35 
 
 		 959 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5952  excinuclease ABC, A subunit  48.3 
 
 		 1984 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3747  UvrA family protein  48.5 
 
 		 1941 aa  225  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0143  excinuclease ABC, A subunit  45.74 
 
 		 1942 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  46.48 
 
 		 946 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0455  excinuclease ABC subunit A  47.29 
 
 		 916 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0811639  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  45.7 
 
 		 941 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06520  excinuclease ABC subunit A  45.91 
 
 		 944 aa  225  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0522  excinuclease ABC subunit A  45.7 
 
 		 944 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0045705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>