202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2494 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2494  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 603 aa  1174    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3690  glycoside hydrolase 15-related  54.79 
 
 		 593 aa  546  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00190476  normal  0.0841535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0382  glycoside hydrolase 15-related  53.92 
 
 		 611 aa  543  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1076  glycoside hydrolase 15-related  52.77 
 
 		 594 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000337356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4858  glycoside hydrolase 15-related  53.87 
 
 		 597 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1183  glycoside hydrolase 15-related  52.43 
 
 		 616 aa  534  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0307  glycoside hydrolase 15-related  49.4 
 
 		 583 aa  486  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00932548 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  31.57 
 
 		 850 aa  226  1e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  29.13 
 
 		 619 aa  210  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  30.58 
 
 		 599 aa  209  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  33.55 
 
 		 867 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1274  glycoside hydrolase 15-related  31.69 
 
 		 628 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.716617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  32.12 
 
 		 613 aa  198  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  30.57 
 
 		 601 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  30.55 
 
 		 627 aa  192  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2670  glycoside hydrolase 15-related protein  30.87 
 
 		 659 aa  188  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206997  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  29.54 
 
 		 595 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  28.34 
 
 		 617 aa  187  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  30.41 
 
 		 586 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  29.2 
 
 		 868 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  32.19 
 
 		 602 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  30.16 
 
 		 619 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  29.89 
 
 		 612 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  30 
 
 		 619 aa  184  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  31.69 
 
 		 604 aa  182  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  29.28 
 
 		 600 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1434  glycoside hydrolase 15-related  29.44 
 
 		 616 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  27.52 
 
 		 594 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  29.59 
 
 		 605 aa  181  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  30.18 
 
 		 596 aa  181  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  30.76 
 
 		 679 aa  181  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  29.82 
 
 		 627 aa  181  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4442  glycoside hydrolase 15-related  30.4 
 
 		 635 aa  181  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807083  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  29.32 
 
 		 620 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3680  glycoside hydrolase 15-related  32.09 
 
 		 876 aa  180  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  31.95 
 
 		 842 aa  180  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  32.08 
 
 		 600 aa  180  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  31.54 
 
 		 602 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2676  glycoside hydrolase 15-related  28.37 
 
 		 672 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  31.54 
 
 		 602 aa  178  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5373  glycoside hydrolase 15-related protein  32.9 
 
 		 786 aa  178  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.534575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35060  trehalose 6-phosphatase  31.15 
 
 		 844 aa  178  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.746667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  30.03 
 
 		 605 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4302  glycoside hydrolase 15-related protein  29.92 
 
 		 593 aa  177  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  29.74 
 
 		 614 aa  177  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  31.35 
 
 		 603 aa  177  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0874  glycoside hydrolase 15-related protein  30.7 
 
 		 645 aa  177  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  30.34 
 
 		 597 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  29.04 
 
 		 642 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  29.89 
 
 		 645 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  30.46 
 
 		 598 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  28.21 
 
 		 677 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  29.35 
 
 		 629 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  28.21 
 
 		 677 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0130  glycoside hydrolase 15-related  29.7 
 
 		 636 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322371  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  29.89 
 
 		 610 aa  176  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  31.02 
 
 		 601 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  28.21 
 
 		 677 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  31.23 
 
 		 609 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  28.21 
 
 		 668 aa  173  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  30.77 
 
 		 598 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2754  glycoside hydrolase 15-related  30.4 
 
 		 607 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  30.23 
 
 		 600 aa  173  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  29.82 
 
 		 602 aa  172  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  31.44 
 
 		 609 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3919  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 867 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.936294  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  30.13 
 
 		 619 aa  171  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  30.48 
 
 		 601 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  29.84 
 
 		 623 aa  171  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  30.2 
 
 		 602 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  29.14 
 
 		 608 aa  171  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  30.92 
 
 		 605 aa  170  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  30.96 
 
 		 609 aa  170  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  30.96 
 
 		 611 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1322  glycoside hydrolase 15-related  29.66 
 
 		 565 aa  169  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.033472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  29.49 
 
 		 629 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  29.28 
 
 		 612 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3711  trehalose-phosphatase  30.31 
 
 		 847 aa  169  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0320844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3889  glycoside hydrolase 15-related protein  30.72 
 
 		 893 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  30.56 
 
 		 602 aa  169  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2783  glycoside hydrolase 15-related protein  28.5 
 
 		 662 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.818274  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  29.77 
 
 		 596 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  27.68 
 
 		 598 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  28.71 
 
 		 623 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  31.47 
 
 		 867 aa  167  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  29.61 
 
 		 603 aa  166  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  28.69 
 
 		 593 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4516  glycoside hydrolase 15-related  32.05 
 
 		 669 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229042 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  29.4 
 
 		 596 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  29.41 
 
 		 636 aa  163  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4565  glycoside hydrolase 15-related protein  30.96 
 
 		 623 aa  163  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  30.96 
 
 		 609 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  30.96 
 
 		 609 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  29.67 
 
 		 592 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  30.33 
 
 		 589 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  30.23 
 
 		 611 aa  161  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0046  hypothetical protein  29.25 
 
 		 612 aa  161  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5896  glycoside hydrolase 15-related  29.78 
 
 		 609 aa  161  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0215966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  28.5 
 
 		 601 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  29.48 
 
 		 592 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>