123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4038 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  558  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.08 
 
 
289 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.36 
 
 
293 aa  317  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.24 
 
 
301 aa  295  8e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36 
 
 
296 aa  170  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1231  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.96 
 
 
315 aa  170  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  32.47 
 
 
320 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  32.47 
 
 
304 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  30.51 
 
 
309 aa  143  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  30.47 
 
 
296 aa  143  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04828  integral membrane protein DUF6  31.56 
 
 
307 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.71 
 
 
282 aa  126  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  30.07 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2955  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.21 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  27.49 
 
 
292 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  28.17 
 
 
298 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  26.28 
 
 
294 aa  102  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  25.89 
 
 
293 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  27.18 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.89 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  29.47 
 
 
299 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  25.53 
 
 
293 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  25.53 
 
 
293 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  26.41 
 
 
290 aa  94  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  26.8 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  25.36 
 
 
292 aa  88.2  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  25.52 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  25 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  24.3 
 
 
296 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  29.97 
 
 
297 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  24.29 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  25.47 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  26.83 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  24.64 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  23.93 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  25.93 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  23.69 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  26.21 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  26.92 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  26.74 
 
 
308 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588.2  DMT family permease  24.24 
 
 
145 aa  59.7  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.29 
 
 
311 aa  60.1  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  24.91 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  26.12 
 
 
296 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  26.12 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  23.92 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.36 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  26.92 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  30.61 
 
 
298 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.53 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.97 
 
 
302 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.19 
 
 
300 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  24.91 
 
 
315 aa  52.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  28.75 
 
 
267 aa  52.8  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.93 
 
 
289 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.09 
 
 
308 aa  52.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  22.7 
 
 
297 aa  52.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 
278 aa  52.4  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  26.15 
 
 
294 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  23.13 
 
 
303 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.25 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 
282 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  24.26 
 
 
304 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.75 
 
 
303 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  22.75 
 
 
303 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  22.35 
 
 
303 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  22.75 
 
 
303 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.64 
 
 
301 aa  49.3  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  22.75 
 
 
303 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  22.75 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.12 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  23.61 
 
 
292 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.34 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0356  transporter, EamA family  24.59 
 
 
301 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4018  hypothetical protein  35.44 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321075 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  23.51 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  24.59 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  23.87 
 
 
301 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.63 
 
 
313 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.18 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  25.29 
 
 
294 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  24.88 
 
 
301 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  21.74 
 
 
311 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4598  hypothetical protein  24.59 
 
 
301 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.67 
 
 
317 aa  46.6  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4883  transporter, EamA family  24.59 
 
 
301 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  24.15 
 
 
294 aa  45.8  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  23.19 
 
 
296 aa  46.2  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  25.4 
 
 
302 aa  45.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  24.14 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  22.82 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  24.14 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.53 
 
 
329 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  24.76 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  26.62 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  24.43 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.95 
 
 
325 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.94 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  20.95 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>