More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3977 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3977  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 675 aa  1382    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.932944  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  27.6 
 
 		 650 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5951  signal transduction histidine kinase, LytS  38.32 
 
 		 975 aa  140  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.580279  normal  0.0504112 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  36.92 
 
 		 1051 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0149  signal transduction histidine kinase, LytS  36.41 
 
 		 1192 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.413609 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01910  Autolysin sensor kinase  40.96 
 
 		 729 aa  130  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.665726  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1280  signal transduction histidine kinase, LytS  37.26 
 
 		 1015 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0152278  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0255  sensor protein  41.04 
 
 		 631 aa  124  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1503  putative phytochrome sensor protein  37.04 
 
 		 1182 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.531436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6581  signal transduction histidine kinase, LytS  34.76 
 
 		 541 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  30.19 
 
 		 671 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  33.65 
 
 		 342 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1007  signal transduction histidine kinase, LytS  34.12 
 
 		 684 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  27.78 
 
 		 420 aa  107  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 422 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  30.81 
 
 		 340 aa  105  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  30.45 
 
 		 367 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2657  signal transduction histidine kinase, LytS  40.14 
 
 		 478 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0672  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 		 289 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  26.34 
 
 		 414 aa  95.1  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  34.97 
 
 		 382 aa  94.4  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  29.81 
 
 		 369 aa  94  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  27.76 
 
 		 390 aa  93.6  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0554  sensor histidine kinase  30.16 
 
 		 583 aa  92.8  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  28.44 
 
 		 389 aa  91.7  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0538  sensor histidine kinase  31.03 
 
 		 583 aa  90.9  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0918  histidine kinase  27.92 
 
 		 443 aa  90.5  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  27.51 
 
 		 381 aa  90.1  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  32.54 
 
 		 566 aa  89.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  29.21 
 
 		 374 aa  88.6  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00390  putative regulator of cell autolysis  29.58 
 
 		 431 aa  89  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.848872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  28.12 
 
 		 362 aa  88.6  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 502 aa  87.8  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  32.5 
 
 		 410 aa  87.8  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1983  putative sensor with HAMP domain  31.25 
 
 		 597 aa  87  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  29.21 
 
 		 410 aa  87  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0386  hypothetical protein  31.35 
 
 		 359 aa  87.4  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  31.41 
 
 		 344 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1178  histidine kinase internal region  29.38 
 
 		 414 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  35.81 
 
 		 587 aa  85.9  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  22.78 
 
 		 374 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  33.72 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3044  signal transduction histidine kinase, LytS  30.09 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4086  signal transduction histidine kinase, LytS  28.11 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  32.04 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  26.27 
 
 		 610 aa  84.7  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  27.04 
 
 		 566 aa  84  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  30.26 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  27.19 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  31.91 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0292  signal transduction histidine kinase, LytS  34.04 
 
 		 506 aa  84  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 580 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000303887  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1584  histidine kinase internal region  40 
 
 		 304 aa  84  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  29.07 
 
 		 600 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  23.69 
 
 		 358 aa  82.8  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  29.47 
 
 		 578 aa  82.8  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 384 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  30.17 
 
 		 333 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  39.2 
 
 		 350 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  38.98 
 
 		 504 aa  83.2  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  31.47 
 
 		 600 aa  83.2  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  34.23 
 
 		 559 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1966  sensor histidine kinase  31.61 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  34.23 
 
 		 559 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  34.23 
 
 		 559 aa  82  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  34.23 
 
 		 559 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1646  putative sensor with HAMP domain  30.41 
 
 		 617 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177984  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  34.23 
 
 		 559 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  29.06 
 
 		 552 aa  82.4  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  34.23 
 
 		 559 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  34.23 
 
 		 565 aa  81.6  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  34.23 
 
 		 565 aa  81.6  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  29.39 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  30.05 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  34.23 
 
 		 565 aa  81.6  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1150  histidine kinase internal region  31.33 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  33.73 
 
 		 603 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  33.33 
 
 		 612 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000429093  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  30.14 
 
 		 572 aa  81.3  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  32.24 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  34.71 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  32.48 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  32.48 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  32.48 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3212  histidine kinase internal region  33.92 
 
 		 596 aa  81.3  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  26.51 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1250  signal transduction histidine kinase, LytS  32.1 
 
 		 574 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.888178  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2283  signal transduction histidine kinase, LytS  30.71 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  30.05 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4305  signal transduction histidine kinase, LytS  30.28 
 
 		 654 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.119677  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  33.56 
 
 		 565 aa  80.9  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  30.77 
 
 		 363 aa  80.1  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1401  histidine kinase  30.17 
 
 		 360 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  29.8 
 
 		 346 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  34.78 
 
 		 369 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1247  signal transduction histidine kinase, LytS  32.35 
 
 		 357 aa  80.5  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  32.02 
 
 		 580 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  29.95 
 
 		 428 aa  79.7  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>