More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3212 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3212  histidine kinase internal region  100 
 
 		 596 aa  1215    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  31.36 
 
 		 610 aa  283  9e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  27.8 
 
 		 594 aa  240  5e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  29.91 
 
 		 600 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  28.5 
 
 		 587 aa  206  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  27.02 
 
 		 612 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000429093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 585 aa  157  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3406  histidine kinase internal region  26.82 
 
 		 603 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.264135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1646  putative sensor with HAMP domain  31.65 
 
 		 617 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2114  putative sensor with HAMP domain  33.2 
 
 		 627 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.28006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 502 aa  136  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2252  histidine kinase internal region  31.71 
 
 		 569 aa  135  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 580 aa  134  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000303887  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2345  sensor histidine kinase  29.74 
 
 		 578 aa  134  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0123193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 640 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000785951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0863  histidine kinase internal region  25.93 
 
 		 599 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2057  sensor histidine kinase  29.93 
 
 		 578 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 576 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1582  signal transduction histidine kinase, LytS  27.99 
 
 		 498 aa  130  9.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0045193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0994  putative sensor with HAMP domain  31.4 
 
 		 603 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0495  histidine kinase internal region  27.19 
 
 		 604 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2122  histidine kinase internal region  29 
 
 		 516 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0398  histidine kinase internal region  32.39 
 
 		 567 aa  121  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1227  histidine kinase  27.87 
 
 		 488 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0578  histidine kinase internal region  27.78 
 
 		 604 aa  122  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1983  putative sensor with HAMP domain  31.05 
 
 		 597 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 483 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1137  putative sensor with HAMP domain  25.19 
 
 		 597 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  32.27 
 
 		 410 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0599  putative sensor with HAMP domain  30.11 
 
 		 623 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.396658  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3248  putative sensor with HAMP domain  26.29 
 
 		 600 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  32.74 
 
 		 465 aa  117  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  29.71 
 
 		 600 aa  117  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  30.7 
 
 		 576 aa  116  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  31.82 
 
 		 410 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  32 
 
 		 363 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  29.8 
 
 		 576 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0199  putative sensor with HAMP domain  29.69 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  30.66 
 
 		 578 aa  112  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  28.8 
 
 		 426 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2140  histidine kinase internal region  27.3 
 
 		 564 aa  111  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  33.04 
 
 		 446 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  30.58 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  29.73 
 
 		 394 aa  111  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  28.34 
 
 		 568 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  34.29 
 
 		 645 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1112  sensor histidine kinase  24.75 
 
 		 574 aa  109  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0193784  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3033  histidine kinase internal region  28.21 
 
 		 633 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0284117  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0554  sensor histidine kinase  29.17 
 
 		 583 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3263  histidine kinase internal region  30.63 
 
 		 397 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3281  signal transduction histidine kinase, LytS  31.88 
 
 		 335 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4590  putative sensor with HAMP domain  29.1 
 
 		 577 aa  108  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  31.47 
 
 		 580 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0538  sensor histidine kinase  29.03 
 
 		 583 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  31.11 
 
 		 450 aa  107  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 446 aa  107  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  30.94 
 
 		 394 aa  107  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1247  signal transduction histidine kinase, LytS  38.04 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  29.91 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  29.28 
 
 		 607 aa  105  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  30.29 
 
 		 420 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 422 aa  105  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  31.08 
 
 		 393 aa  104  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.67 
 
 		 414 aa  104  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  33.02 
 
 		 557 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  33.02 
 
 		 557 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  33.02 
 
 		 557 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0526  histidine kinase internal region  29.92 
 
 		 594 aa  104  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1721  histidine kinase internal region  28.41 
 
 		 573 aa  103  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  33.02 
 
 		 557 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  33.02 
 
 		 557 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  27.11 
 
 		 565 aa  103  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1585  signal transduction histidine kinase, LytS  30.92 
 
 		 574 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  29.12 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0617  signal transduction histidine kinase, LytS  29.44 
 
 		 601 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 565 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  33.02 
 
 		 557 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  29.26 
 
 		 567 aa  101  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  29.28 
 
 		 400 aa  101  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  27.85 
 
 		 394 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  28.83 
 
 		 405 aa  100  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  28.33 
 
 		 1051 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  32.09 
 
 		 581 aa  100  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  29.15 
 
 		 398 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 565 aa  99.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  29.02 
 
 		 411 aa  100  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  30.04 
 
 		 391 aa  99.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  29.28 
 
 		 432 aa  99.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  30.67 
 
 		 558 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1393  histidine kinase internal region  34.18 
 
 		 586 aa  99  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000217072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  30.24 
 
 		 1018 aa  99.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  28.12 
 
 		 408 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  34 
 
 		 566 aa  99.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  30.36 
 
 		 403 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  30.36 
 
 		 403 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  30.36 
 
 		 403 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  30.54 
 
 		 831 aa  98.6  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4128  signal transduction histidine kinase, LytS  29.9 
 
 		 338 aa  98.2  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  27.68 
 
 		 561 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>