More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1227 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1227  histidine kinase  100 
 
 
488 aa  997    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2122  histidine kinase internal region  36.53 
 
 
516 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 
585 aa  240  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.92 
 
 
580 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000303887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1983  putative sensor with HAMP domain  40 
 
 
597 aa  212  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24245  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2252  histidine kinase internal region  40.07 
 
 
569 aa  207  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19850  histidine kinase internal region  42.44 
 
 
595 aa  203  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0994  putative sensor with HAMP domain  35.48 
 
 
603 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0495  histidine kinase internal region  37.97 
 
 
604 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4590  putative sensor with HAMP domain  38.81 
 
 
577 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0398  histidine kinase internal region  37.73 
 
 
567 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1137  putative sensor with HAMP domain  41.22 
 
 
597 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  37.77 
 
 
600 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0538  sensor histidine kinase  33.78 
 
 
583 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0554  sensor histidine kinase  34.26 
 
 
583 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3406  histidine kinase internal region  35.29 
 
 
603 aa  174  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.264135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0199  putative sensor with HAMP domain  37.29 
 
 
589 aa  171  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0578  histidine kinase internal region  33.1 
 
 
604 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2114  putative sensor with HAMP domain  31.39 
 
 
627 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.28006  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3248  putative sensor with HAMP domain  32.07 
 
 
600 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1582  signal transduction histidine kinase, LytS  31.67 
 
 
498 aa  154  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0045193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0526  histidine kinase internal region  33.09 
 
 
594 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0863  histidine kinase internal region  30 
 
 
599 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1112  sensor histidine kinase  33.44 
 
 
574 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0193784  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  37.16 
 
 
414 aa  150  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0599  putative sensor with HAMP domain  33.46 
 
 
623 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.396658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3033  histidine kinase internal region  32.34 
 
 
633 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0284117  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2345  sensor histidine kinase  32.05 
 
 
578 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0123193  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2057  sensor histidine kinase  32.62 
 
 
578 aa  147  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  32.69 
 
 
587 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  37.6 
 
 
578 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
576 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  32.4 
 
 
600 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0292  signal transduction histidine kinase, LytS  35.59 
 
 
506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  31.79 
 
 
612 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000429093  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  31.91 
 
 
610 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  34.1 
 
 
576 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
640 aa  134  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000785951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3281  signal transduction histidine kinase, LytS  34.1 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  29.83 
 
 
594 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1646  putative sensor with HAMP domain  32.68 
 
 
617 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  34.58 
 
 
607 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3857  signal transduction histidine kinase, LytS  29.1 
 
 
581 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000136608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  32.06 
 
 
426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  31.63 
 
 
565 aa  127  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  32.09 
 
 
565 aa  126  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  29.57 
 
 
495 aa  126  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2140  histidine kinase internal region  26.21 
 
 
564 aa  125  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  31.75 
 
 
565 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4128  signal transduction histidine kinase, LytS  30.05 
 
 
338 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
502 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  32.91 
 
 
568 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  33.17 
 
 
455 aa  123  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3212  histidine kinase internal region  27.87 
 
 
596 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 
561 aa  121  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  33.88 
 
 
567 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  32.55 
 
 
465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  33.94 
 
 
576 aa  120  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1250  signal transduction histidine kinase, LytS  29.6 
 
 
574 aa  119  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.888178  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  32.13 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  32.14 
 
 
591 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  32.71 
 
 
565 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  33.63 
 
 
446 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  31.1 
 
 
394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  30.43 
 
 
522 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  30.43 
 
 
589 aa  117  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  30.43 
 
 
589 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  30.43 
 
 
589 aa  117  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  30.43 
 
 
589 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  30.43 
 
 
589 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  30.43 
 
 
589 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  30.57 
 
 
568 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  32.85 
 
 
450 aa  116  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  31.25 
 
 
577 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  33.97 
 
 
569 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  30.04 
 
 
589 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  31.3 
 
 
564 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  29.54 
 
 
580 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  32.23 
 
 
572 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  29.91 
 
 
411 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  32.23 
 
 
572 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1393  histidine kinase internal region  34.35 
 
 
586 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000217072  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1721  histidine kinase internal region  30.4 
 
 
573 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  34.22 
 
 
558 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  29.64 
 
 
589 aa  114  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  32.69 
 
 
568 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  29.25 
 
 
398 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  32.62 
 
 
558 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  31.01 
 
 
589 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  29.81 
 
 
561 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  32.23 
 
 
410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  32.38 
 
 
645 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1585  signal transduction histidine kinase, LytS  31.73 
 
 
574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3263  histidine kinase internal region  32.37 
 
 
397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  28.85 
 
 
563 aa  111  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2372  histidine kinase internal region  33.82 
 
 
595 aa  111  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  29.81 
 
 
561 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  29.81 
 
 
561 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>