More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3769 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4916  DNA polymerase III, alpha subunit  43.15 
 
 		 989 aa  825    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188475  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3769  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1018 aa  2127    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3569  DNA polymerase III, alpha subunit  75.1 
 
 		 1017 aa  1626    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3236  DNA polymerase III, alpha subunit  48.88 
 
 		 980 aa  935    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6872  DNA polymerase III, alpha subunit  48.27 
 
 		 982 aa  910    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1371  DNA polymerase III, alpha subunit  51.07 
 
 		 979 aa  985    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.940819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0499  DNA polymerase III, alpha subunit  32.02 
 
 		 1029 aa  475  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1741  DNA polymerase III, alpha subunit  31.97 
 
 		 1047 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0237  DNA polymerase III, alpha subunit  32.38 
 
 		 1003 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0516  DNA polymerase III, alpha subunit  33.73 
 
 		 1079 aa  445  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0929  DNA polymerase III, alpha subunit  30.22 
 
 		 1003 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  30.87 
 
 		 1156 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  30.83 
 
 		 1127 aa  392  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  30.67 
 
 		 1139 aa  385  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  29.41 
 
 		 1145 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  29.91 
 
 		 1130 aa  379  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  34.69 
 
 		 1075 aa  379  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  31.07 
 
 		 1122 aa  375  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  29.09 
 
 		 1145 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  29.06 
 
 		 1181 aa  368  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4714  DNA polymerase III DnaE  28.43 
 
 		 1108 aa  363  9e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0523  DNA polymerase III DnaE  28.43 
 
 		 1108 aa  363  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  30.7 
 
 		 1170 aa  363  1e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  30.47 
 
 		 1170 aa  362  3e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  30.64 
 
 		 1170 aa  361  3e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4333  DNA polymerase III DnaE  28.43 
 
 		 1108 aa  361  5e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4730  DNA polymerase III DnaE  28.53 
 
 		 1108 aa  360  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4719  DNA polymerase III DnaE  28.43 
 
 		 1108 aa  360  8e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4498  DNA polymerase III DnaE  28.53 
 
 		 1108 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4345  DNA polymerase III DnaE  28.43 
 
 		 1108 aa  360  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4849  DNA polymerase III DnaE  28.53 
 
 		 1108 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4434  DNA polymerase III DnaE  28.45 
 
 		 1110 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4735  DNA polymerase III DnaE  28.24 
 
 		 1108 aa  358  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3288  DNA polymerase III DnaE  28.45 
 
 		 1109 aa  358  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  28.98 
 
 		 1225 aa  356  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0773  DNA polymerase III, alpha subunit  29.04 
 
 		 1092 aa  355  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  29.63 
 
 		 1148 aa  355  4e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1009  DNA polymerase III, alpha subunit  32.01 
 
 		 1039 aa  350  8e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0533804  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0750  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  28.59 
 
 		 1115 aa  348  3e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1759  DNA polymerase III, alpha subunit  30.2 
 
 		 1065 aa  347  6e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.463991  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1793  DNA polymerase III, alpha subunit  30.2 
 
 		 1065 aa  347  6e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1165  DNA polymerase III DnaE  30.47 
 
 		 1036 aa  347  8.999999999999999e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  27.7 
 
 		 1176 aa  345  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  29.78 
 
 		 1151 aa  345  2.9999999999999997e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  29.54 
 
 		 1173 aa  343  9e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1266  DNA polymerase III, alpha subunit  29.44 
 
 		 1065 aa  342  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.502736  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3197  DNA polymerase III, alpha subunit  29.99 
 
 		 1139 aa  340  5.9999999999999996e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  28.78 
 
 		 1132 aa  340  8e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  28.85 
 
 		 1149 aa  340  9.999999999999999e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  30 
 
 		 1159 aa  339  1.9999999999999998e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  26.99 
 
 		 1165 aa  337  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1148 aa  337  9e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_002978  WD0780  DNA polymerase III, alpha subunit  29.06 
 
 		 1109 aa  336  1e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.493984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  32.92 
 
 		 1139 aa  337  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  27.41 
 
 		 1171 aa  333  8e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  27.96 
 
 		 1165 aa  332  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  29.54 
 
 		 1174 aa  332  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2690  DNA polymerase III, alpha subunit  28.17 
 
 		 1104 aa  333  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  27.96 
 
 		 1182 aa  332  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  29.63 
 
 		 1182 aa  332  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3606  DNA polymerase III, alpha subunit  28.37 
 
 		 1178 aa  330  8e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402124  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  28.85 
 
 		 1190 aa  330  9e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  27.3 
 
 		 1165 aa  329  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  27.45 
 
 		 1165 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  29.66 
 
 		 1134 aa  328  3e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0880  DNA polymerase III, alpha subunit  27.4 
 
 		 1038 aa  328  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191787  hitchhiker  0.00000000000153929 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0939  DNA polymerase III DnaE  29.47 
 
 		 1034 aa  327  7e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3552  DNA polymerase III, alpha subunit  28.21 
 
 		 1217 aa  327  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.658792  hitchhiker  0.00874617 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2870  DNA polymerase III subunit alpha  30.08 
 
 		 1177 aa  325  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.91064  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0774  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  26.8 
 
 		 1112 aa  326  2e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  28.09 
 
 		 1164 aa  325  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  28.68 
 
 		 1180 aa  324  6e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1611  DNA polymerase III, alpha subunit  26.46 
 
 		 1053 aa  324  6e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  29.06 
 
 		 1175 aa  323  7e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1325  DNA polymerase III, alpha subunit  27.33 
 
 		 1026 aa  323  8e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  28.38 
 
 		 1172 aa  323  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1028  pantoate-beta-alanine ligase  27.31 
 
 		 1029 aa  323  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2808  DNA polymerase III subunit alpha  32.35 
 
 		 1143 aa  322  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.30719  normal  0.975511 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  26.56 
 
 		 1155 aa  321  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0872  DNA polymerase III subunit alpha  27.96 
 
 		 1161 aa  321  5e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.224124  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1836  DNA polymerase III subunit alpha  29.33 
 
 		 1164 aa  321  6e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  29.66 
 
 		 1168 aa  320  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  28.93 
 
 		 1174 aa  319  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  28.19 
 
 		 1240 aa  319  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1028  DNA polymerase III subunit alpha  29.52 
 
 		 1160 aa  318  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2531  DNA polymerase III, alpha subunit  27.82 
 
 		 1085 aa  318  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465943 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  29.46 
 
 		 1168 aa  318  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1081  DNA polymerase III subunit alpha  29.52 
 
 		 1171 aa  318  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.990862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3420  DNA polymerase III subunit alpha  29.52 
 
 		 1171 aa  318  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1251  DNA polymerase III subunit alpha  28.43 
 
 		 1196 aa  318  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477204 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  26.48 
 
 		 1165 aa  318  4e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0995  error-prone DNA polymerase  30.43 
 
 		 1090 aa  317  9e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3593  DNA polymerase III, alpha subunit  28.5 
 
 		 1210 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  28.1 
 
 		 1172 aa  315  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2599  DNA polymerase III, alpha subunit  26.44 
 
 		 1040 aa  315  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  28.28 
 
 		 1210 aa  315  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0592  DNA polymerase III subunit alpha  28.72 
 
 		 1161 aa  314  3.9999999999999997e-84  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3204  DNA polymerase III, alpha subunit  25.34 
 
 		 1074 aa  314  4.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  27.7 
 
 		 1165 aa  314  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1698  DNA polymerase III, alpha subunit  29.63 
 
 		 1152 aa  314  4.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>