More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3291 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  399  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  50.77 
 
 		 197 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  42.41 
 
 		 197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 202 aa  150  8.999999999999999e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  42.61 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 198 aa  128  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 196 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 196 aa  104  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5582  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
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NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  26.82 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0376  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  23.88 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  19.27 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  21.47 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0375  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0366  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.100088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0363  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  23.2 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0389  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0433  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0370  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  22.86 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0455  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0937341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4869  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0503  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  20.63 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
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NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  21.81 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  25.89 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
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NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
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NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  24.44 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
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NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
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NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  20.42 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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