More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2956 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2956  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  353  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0787  hypothetical protein  52.3 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12023  hypothetical protein  46.84 
 
 		 181 aa  160  6e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0790  hypothetical protein  37.35 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0520  hypothetical protein  39.39 
 
 		 179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001007  small-conductance mechanosensitive channel  37.89 
 
 		 197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3635  hypothetical protein  39.1 
 
 		 181 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3512  hypothetical protein  39.1 
 
 		 181 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0852  hypothetical protein  39.1 
 
 		 181 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3441  hypothetical protein  39.1 
 
 		 181 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07084  hypothetical protein  36.65 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0899  hypothetical protein  39.1 
 
 		 181 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0804  hypothetical protein  37.82 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3219  hypothetical protein  37.82 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3322  hypothetical protein  37.82 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0614  hypothetical protein  37.5 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4184  small-conductance mechanosensitive channel  37.41 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0381  hypothetical protein  35.53 
 
 		 189 aa  104  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0961  hypothetical protein  44.54 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3043  hypothetical protein  40.6 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00718  hypothetical protein  37.17 
 
 		 207 aa  84.3  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.737648  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0258  hypothetical protein  31.9 
 
 		 200 aa  84.3  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0417  hypothetical protein  34.91 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101281  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1265  small-conductance mechanosensitive channel  31.03 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.455732 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1549  hypothetical protein  31.03 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0105  hypothetical protein  49.15 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  24.36 
 
 		 400 aa  65.1  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  24.14 
 
 		 421 aa  61.6  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1747  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  27.21 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346445 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  23.4 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 298 aa  57.8  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  25.17 
 
 		 385 aa  57.8  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2605  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  34.02 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0949581  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  22.82 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  27.04 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3252  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  31.54 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.309546 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5251  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  26.32 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3136  hypothetical protein  26.67 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0229  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  28.57 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.727419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  27.15 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  27.16 
 
 		 809 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0290  hypothetical protein  30.38 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 308 aa  53.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  26.35 
 
 		 404 aa  53.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  32.58 
 
 		 779 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  23.68 
 
 		 408 aa  52.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  22.82 
 
 		 282 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  27.39 
 
 		 294 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3051  hypothetical protein  32.65 
 
 		 208 aa  51.6  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129241 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1606  MscS mechanosensitive ion channel  31.43 
 
 		 307 aa  51.6  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.696801  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1802  hypothetical protein  39.47 
 
 		 187 aa  51.6  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0727976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 883 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  24.2 
 
 		 414 aa  50.8  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  28.05 
 
 		 1107 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  28.05 
 
 		 1107 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1107 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1103 aa  50.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1107 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1107 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1107 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1107 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1107 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0384  hypothetical protein  28.39 
 
 		 1107 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1637  hypothetical protein  38.16 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 304 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  26.42 
 
 		 277 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  24.07 
 
 		 293 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3756  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1107 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1107 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0482  hypothetical protein  36.84 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.215693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2944  hypothetical protein  29.03 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0723144  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 275 aa  49.3  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  23.72 
 
 		 280 aa  49.3  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 291 aa  48.9  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 		 296 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  24.39 
 
 		 275 aa  48.9  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  27.88 
 
 		 277 aa  48.9  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02189  hypothetical protein  31.15 
 
 		 249 aa  48.9  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 283 aa  48.9  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  23.23 
 
 		 879 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 336 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0473  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1104 aa  48.5  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 479 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0421  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1115 aa  48.5  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.693078  hitchhiker  0.0000017841 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  25.9 
 
 		 274 aa  48.5  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0442  MscS Mechanosensitive ion channel  26.45 
 
 		 279 aa  48.1  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5057  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  24.05 
 
 		 238 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.755901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  23.57 
 
 		 275 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  27.05 
 
 		 794 aa  48.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1712  MscS mechanosensitive ion channel  31.3 
 
 		 291 aa  48.1  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  22.78 
 
 		 856 aa  48.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  23.57 
 
 		 275 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1247  transmembrane protein  28.19 
 
 		 435 aa  47.8  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.072199  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4616  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1108 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.115019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1108 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4708  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1108 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1108 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4765  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1108 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514219  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  24.38 
 
 		 275 aa  47.8  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  22.88 
 
 		 301 aa  47.8  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>