86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1634 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  100 
 
 		 444 aa  926    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  65.49 
 
 		 427 aa  580  1e-164  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  44.23 
 
 		 400 aa  358  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  40 
 
 		 435 aa  321  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1426  membrane protein containing cytochrome c domain protein  61.57 
 
 		 233 aa  296  4e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  40.53 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  37.74 
 
 		 416 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  44.72 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0843  hypothetical protein  32.77 
 
 		 216 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0847  hypothetical protein  32.77 
 
 		 216 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0795  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  33.98 
 
 		 253 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6894  chaperone protein HtpG  33.68 
 
 		 229 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1596  chaperone protein HtpG  31.8 
 
 		 216 aa  126  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5825  chaperone protein HtpG  36.72 
 
 		 218 aa  126  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024458  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4427  chaperone protein HtpG  35.9 
 
 		 216 aa  126  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0840  hypothetical protein  32.08 
 
 		 216 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5956  chaperone protein HtpG  33.5 
 
 		 220 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1237  chaperone protein HtpG  32.66 
 
 		 214 aa  124  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  38.24 
 
 		 171 aa  123  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6222  chaperone protein HtpG  36.09 
 
 		 219 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385965  decreased coverage  0.00955528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  33.85 
 
 		 219 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  39.73 
 
 		 219 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4188  chaperone protein HtpG  35.95 
 
 		 218 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0017  chaperone protein HtpG  39.73 
 
 		 219 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  29.78 
 
 		 215 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  27.88 
 
 		 211 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  35.32 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3935  cytochrome c family protein  32.65 
 
 		 217 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  35.36 
 
 		 171 aa  117  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  32.16 
 
 		 220 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2550  cytochrome c family protein  28.64 
 
 		 181 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2714  hypothetical protein  33.9 
 
 		 214 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.272646  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1215  putative cytochrome c  38 
 
 		 234 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.422839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1044  chaperone protein HtpG  30.83 
 
 		 219 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  35.9 
 
 		 183 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3004  chaperone protein HtpG  35.1 
 
 		 238 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955215 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0103  hypothetical protein  38.75 
 
 		 183 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  31.61 
 
 		 217 aa  106  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1462  hypothetical protein  31.03 
 
 		 226 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0873129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  34.48 
 
 		 220 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0408  hypothetical protein  44.58 
 
 		 149 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0357243  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2297  hypothetical protein  32.38 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1019  hypothetical protein  34.65 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2546  hypothetical protein  26.6 
 
 		 220 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000133101  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  30.53 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  26.74 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  29.7 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  29.06 
 
 		 327 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  28.21 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0611  hypothetical protein  27.93 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  28.21 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  28.44 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0773  cytochrome c, class I  35.51 
 
 		 326 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2573  hypothetical protein  32.04 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3450  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  28.85 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0446  cytochrome c class I  43.33 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000163065  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1274  cytochrome c class I  30.34 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3390  hypothetical protein  26.58 
 
 		 179 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2011  hypothetical protein  33.61 
 
 		 152 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  29.29 
 
 		 561 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  34.51 
 
 		 278 aa  53.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0692  cytochrome c class I  43.4 
 
 		 153 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.189823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  32.31 
 
 		 265 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  28.4 
 
 		 220 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  30.39 
 
 		 350 aa  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0270  hypothetical protein  27.03 
 
 		 178 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3745  cytochrome C  29.31 
 
 		 545 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110713  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  29.66 
 
 		 351 aa  46.6  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  29.82 
 
 		 215 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  29.91 
 
 		 265 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3137  cytochrome c family protein  29.91 
 
 		 265 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  29.82 
 
 		 206 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  29.82 
 
 		 206 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  29.82 
 
 		 206 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  28.1 
 
 		 124 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  30.36 
 
 		 308 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  29.75 
 
 		 225 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.51 
 
 		 487 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.51 
 
 		 487 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.51 
 
 		 535 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  36.51 
 
 		 535 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.51 
 
 		 535 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.13 
 
 		 487 aa  43.5  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2140  cytochrome c, class I  46.81 
 
 		 87 aa  43.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0189398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>