More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0882 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0882  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 166 aa  336  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1662  putative PAS/PAC sensor protein  38 
 
 		 157 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18425  normal  0.642578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0526  putative PAS/PAC sensor protein  38 
 
 		 157 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6357  PAS sensor protein  36 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1091  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.58 
 
 		 424 aa  81.3  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0113  PAS sensor protein  34.65 
 
 		 160 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 1562 aa  77.8  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  33.33 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3363  PAS sensor protein  34 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.435353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4785  PAS sensor protein  34 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 		 1692 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 336 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  30.61 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2903  putative PAS/PAC sensor protein  34.91 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.097748  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2511  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.73 
 
 		 419 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  36.05 
 
 		 541 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  36.05 
 
 		 541 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1042  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.13 
 
 		 1059 aa  70.9  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.192885 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4536  putative PAS/PAC sensor protein  36.63 
 
 		 194 aa  70.5  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3564  histidine kinase  35.05 
 
 		 544 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01583  Response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  31.48 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 578 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 1207 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 1877 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2700  histidine kinase  35.23 
 
 		 534 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483155  normal  0.0451896 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4845  putative PAS/PAC sensor protein  34.07 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  34.02 
 
 		 463 aa  68.2  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2346  hypothetical protein  32.95 
 
 		 364 aa  68.2  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1232  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.59 
 
 		 416 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  33.72 
 
 		 541 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1171  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.59 
 
 		 416 aa  67.4  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.137039  normal  0.392599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 		 1820 aa  67.4  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5593  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.18 
 
 		 448 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 488 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  31.4 
 
 		 533 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  30.14 
 
 		 587 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235799 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  33.33 
 
 		 943 aa  67  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1140  putative PAS/PAC sensor protein  32.04 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 488 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  31.96 
 
 		 488 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 884 aa  66.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  33.33 
 
 		 810 aa  66.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  34.02 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.65 
 
 		 1017 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6213  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 		 559 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 814 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3242  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  34.02 
 
 		 880 aa  65.5  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1778  putative PAS/PAC sensor protein  34 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0428766  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  35.23 
 
 		 534 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0188  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.53 
 
 		 578 aa  65.5  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  33.72 
 
 		 539 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4262  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.38 
 
 		 861 aa  65.1  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  26.09 
 
 		 760 aa  65.1  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 366 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.7 
 
 		 1183 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543508  normal  0.654737 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4063  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.7 
 
 		 1183 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  30.43 
 
 		 366 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  31.4 
 
 		 507 aa  64.3  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1833  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 687 aa  63.9  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1437  PAS fold domain protein  28.26 
 
 		 184 aa  63.9  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.298234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  26.83 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1348  sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  31.13 
 
 		 763 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1159  PAS:GGDEF  31.13 
 
 		 748 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 		 959 aa  63.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0623  signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 913 aa  63.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 839 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5540  sensory box histidine kinase  30.93 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  30.51 
 
 		 853 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03712  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1178 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433519  normal  0.713314 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 654 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4511  putative PAS/PAC sensor protein  30.93 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 888 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 		 1313 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2624  putative PAS/PAC sensor protein  26.97 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 778 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  30.23 
 
 		 544 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 890 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3604  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 1172 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 503 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0088  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.6 
 
 		 1108 aa  62  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4938  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.9 
 
 		 1027 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.393519 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1292  putative PAS/PAC sensor protein  26.97 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  30.09 
 
 		 354 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  27.83 
 
 		 723 aa  61.6  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3604  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 354 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 477 aa  61.2  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  27.12 
 
 		 644 aa  61.2  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  32.56 
 
 		 531 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1787  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0876  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.99 
 
 		 709 aa  60.8  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0730078  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.23 
 
 		 1238 aa  60.5  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3160  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.56 
 
 		 929 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.968718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0590  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.44 
 
 		 1144 aa  60.5  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.851066  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6934  signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0476013  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>