118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_1084 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  77.8 
 
 
419 aa  698    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  100 
 
 
419 aa  864    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  44.39 
 
 
418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  33.63 
 
 
451 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  37.78 
 
 
379 aa  157  4e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.88 
 
 
403 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.81 
 
 
403 aa  143  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  27.74 
 
 
403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.53 
 
 
399 aa  123  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  31.27 
 
 
359 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  33 
 
 
359 aa  117  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  24.85 
 
 
397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  35.38 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.36 
 
 
389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  31.36 
 
 
359 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  35.83 
 
 
360 aa  114  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  35.27 
 
 
351 aa  113  7.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.86 
 
 
405 aa  110  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.1 
 
 
349 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  33.98 
 
 
357 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  32.62 
 
 
348 aa  106  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  33.18 
 
 
351 aa  102  9e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  31.06 
 
 
356 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  33.5 
 
 
354 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  29.58 
 
 
351 aa  101  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  25.91 
 
 
352 aa  101  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.57 
 
 
454 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  22.28 
 
 
423 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  26.37 
 
 
347 aa  97.8  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  27.84 
 
 
353 aa  96.7  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30.73 
 
 
352 aa  96.7  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  31.5 
 
 
338 aa  94.4  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  26.18 
 
 
358 aa  94.4  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  31.03 
 
 
342 aa  93.2  7e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  31.8 
 
 
353 aa  92.8  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.53 
 
 
356 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  31.84 
 
 
342 aa  91.7  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  28.73 
 
 
350 aa  92  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.57 
 
 
355 aa  91.3  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  31.44 
 
 
341 aa  91.7  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  31.75 
 
 
353 aa  90.5  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  31.02 
 
 
349 aa  90.5  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  30.84 
 
 
342 aa  88.6  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  30.26 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.73 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  28.77 
 
 
459 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  29.5 
 
 
357 aa  84  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  27.31 
 
 
354 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  29.23 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  25.94 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  28.22 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  25.13 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.71 
 
 
334 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  25.75 
 
 
362 aa  64.3  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  22.7 
 
 
364 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  22.7 
 
 
364 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  24.35 
 
 
364 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  25.33 
 
 
383 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  25 
 
 
364 aa  59.7  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  29.21 
 
 
334 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  26.06 
 
 
356 aa  57  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  26.06 
 
 
349 aa  56.2  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  24.44 
 
 
367 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  24.44 
 
 
367 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  24.44 
 
 
367 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  24.44 
 
 
367 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  22.84 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  28.8 
 
 
334 aa  54.7  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  22.31 
 
 
367 aa  54.3  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  24.44 
 
 
367 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  23.22 
 
 
395 aa  53.5  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0474  3-dehydroquinate synthase  25.57 
 
 
366 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.27 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1714  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 
362 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0902  iron-containing alcohol dehydrogenase  25 
 
 
373 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.01 
 
 
363 aa  50.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.34 
 
 
373 aa  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  28.16 
 
 
362 aa  49.7  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  26.26 
 
 
352 aa  49.3  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  22.01 
 
 
360 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.02 
 
 
364 aa  49.7  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  23.77 
 
 
367 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.09 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  22.54 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  22.94 
 
 
370 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  20.56 
 
 
361 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0781  3-dehydroquinate synthase  24.41 
 
 
351 aa  47.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0051  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.08 
 
 
361 aa  47  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00126649  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4666  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.95 
 
 
360 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  21.91 
 
 
366 aa  46.6  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  20.66 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  20.66 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.46 
 
 
377 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  20.66 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  20.66 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  20.66 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  20.66 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  19.09 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  20.66 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  20.25 
 
 
367 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>