170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0915 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  93.81 
 
 
437 aa  706    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  93.81 
 
 
437 aa  689    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  100 
 
 
438 aa  865    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  95.18 
 
 
451 aa  697    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  93.1 
 
 
434 aa  677    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  94.5 
 
 
437 aa  695    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  93.35 
 
 
439 aa  701    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2230  tail fiber protein  85.78 
 
 
407 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000293165 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1096  side tail fiber protein  92.59 
 
 
411 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  89.95 
 
 
645 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  78.62 
 
 
1007 aa  254  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1637  L-shaped tail fiber protein  91.8 
 
 
1258 aa  244  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  76.1 
 
 
1137 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  87.7 
 
 
1120 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  74.21 
 
 
401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  74.21 
 
 
401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1206  putative prophage side tail fiber protein  92.79 
 
 
845 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.116414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00513  conserved hypothetical protein  92.66 
 
 
198 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  77.46 
 
 
790 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  77.46 
 
 
791 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  76.76 
 
 
892 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  76.06 
 
 
805 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3184  tail fiber protein  91.3 
 
 
92 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000807909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1882  tail fiber protein  91.3 
 
 
92 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0362623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5544  tail fiber protein  89.13 
 
 
92 aa  170  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  54.2 
 
 
2914 aa  114  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  53.49 
 
 
523 aa  107  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  49.1 
 
 
582 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  55.45 
 
 
2851 aa  104  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  47.3 
 
 
400 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  56.76 
 
 
347 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  56.76 
 
 
347 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  55.37 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  45.65 
 
 
403 aa  93.2  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  49.3 
 
 
481 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  55.46 
 
 
442 aa  92.8  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  49.3 
 
 
478 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  51.91 
 
 
585 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  55.28 
 
 
813 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  56.76 
 
 
512 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  50.36 
 
 
842 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  53.28 
 
 
300 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  51.22 
 
 
462 aa  87  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  52 
 
 
459 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  55.2 
 
 
1168 aa  86.7  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  45.77 
 
 
466 aa  86.7  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  52.5 
 
 
936 aa  86.7  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  37.73 
 
 
492 aa  86.7  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  54.17 
 
 
706 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  51.22 
 
 
1147 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  49.62 
 
 
815 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  48.18 
 
 
468 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  51.46 
 
 
689 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  53.33 
 
 
606 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  43.7 
 
 
473 aa  84.7  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  50.41 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  50.89 
 
 
469 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  48.03 
 
 
524 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  49.19 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  47.41 
 
 
380 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  48.15 
 
 
748 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  51.26 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  37.5 
 
 
493 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 
274 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  54.55 
 
 
643 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  43.88 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  51.38 
 
 
647 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 
587 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  42.95 
 
 
1101 aa  80.5  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  51.72 
 
 
639 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  54.21 
 
 
835 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  53.7 
 
 
1451 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  54.95 
 
 
366 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  52.59 
 
 
835 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  53.54 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  55.56 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  47.83 
 
 
717 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  50 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  48.12 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  46.38 
 
 
1055 aa  77  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  51.64 
 
 
934 aa  77  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  46.1 
 
 
712 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  51.11 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  51.28 
 
 
474 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  53.19 
 
 
1426 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  51.26 
 
 
867 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  46.83 
 
 
1219 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2594  hypothetical protein  38.76 
 
 
468 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  60 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  50.5 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  49.61 
 
 
1321 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  54.55 
 
 
1297 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 
542 aa  73.2  0.000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  43.51 
 
 
300 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  53.15 
 
 
1170 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  52.69 
 
 
299 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  48.82 
 
 
951 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  45.11 
 
 
835 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  45.54 
 
 
582 aa  72  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  54.9 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>