More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3091 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008741  Dvul_3091  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
108 aa  214  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1529  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  67.59 
 
 
118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0743  nitrogen regulatory protein P-II  70.37 
 
 
118 aa  161  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2614  nitrogen regulatory protein P-II  69.16 
 
 
116 aa  160  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1018  nitrogen regulatory protein P-II  66.36 
 
 
118 aa  159  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.466581  normal  0.730099 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1245  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.67 
 
 
117 aa  157  5e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323623  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1628  nitrogen regulatory protein P-II  69.16 
 
 
118 aa  157  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000194197  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0684  nitrogen regulatory protein P-II  66.67 
 
 
117 aa  157  6e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1752  nitrogen regulatory protein P-II  66.67 
 
 
118 aa  154  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.435778  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1950  nitrogen regulatory protein P-II  64.49 
 
 
118 aa  149  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0120219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0835  nitrogen regulatory protein P-II  63.55 
 
 
118 aa  147  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1157  nitrogen regulatory protein P-II  64.42 
 
 
108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1024  nitrogen regulatory protein P-II  65.09 
 
 
108 aa  144  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2820  nitrogen regulatory protein P-II  63.55 
 
 
109 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.777826  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1143  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 
108 aa  126  8.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.903165  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0560  nitrogen regulatory protein P-II  52.88 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000121582  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1047  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 
105 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  54.63 
 
 
106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  56.07 
 
 
105 aa  114  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  51.46 
 
 
105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0170  nitrogen regulatory protein P-II  51.92 
 
 
105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.01556  normal  0.599524 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0099  nitrogen regulatory protein P-II  52.43 
 
 
105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.477301  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1802  nitrogen regulatory protein P-II  52.43 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  52.43 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2280  nitrogen regulatory protein P-II  50.96 
 
 
105 aa  98.2  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000332901  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1555  P-II family nitrogen regulatory protein  48.54 
 
 
105 aa  87  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0437  nitrogen regulatory protein P-II  44.04 
 
 
126 aa  84.3  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527989  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  49 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  43.64 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  42.45 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0566  nitrogen regulatory protein P-II  45.37 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000025386  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  44.44 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  45.37 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  42 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  35.9 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  35.9 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  35.04 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  44.44 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  41.82 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1640  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.563985  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3176  nitrogen regulatory protein P-II  42.34 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00223348 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  42.73 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0186  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 
125 aa  70.1  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1356  nitrogen regulatory protein P-II  42.45 
 
 
124 aa  70.1  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.51478  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2530  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.18925  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  43.64 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  42.59 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  44.44 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  42.73 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  37.07 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  39.81 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  42.34 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1359  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202328  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18621  nitrogen regulatory protein P-II  42.34 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.436109  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  40.18 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  41.82 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1361  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.212904  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  35.65 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  41.28 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  67  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0297  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
109 aa  67  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0187  ammonium transporter  42.45 
 
 
555 aa  67  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  40.18 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  41.82 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  40.18 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  40.74 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  40.74 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  42.73 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  42.99 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  42.73 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>