More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1163 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1163  phage integrase family protein  100 
 
 		 472 aa  936    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.562087  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0767  integrase family protein  67.55 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0883457 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  71.86 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  62.69 
 
 		 373 aa  227  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  59.76 
 
 		 312 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  36.98 
 
 		 395 aa  186  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0891  integrase family protein  62.8 
 
 		 306 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  36.68 
 
 		 336 aa  179  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  49.48 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  53.94 
 
 		 302 aa  177  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  53.94 
 
 		 302 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  54.88 
 
 		 317 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  53.29 
 
 		 306 aa  173  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.66 
 
 		 355 aa  168  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  51.83 
 
 		 296 aa  167  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  49.69 
 
 		 298 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  45.71 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  43.62 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  43.05 
 
 		 302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  32.1 
 
 		 322 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  52.87 
 
 		 304 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  52.76 
 
 		 298 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.85 
 
 		 303 aa  163  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  52.76 
 
 		 293 aa  163  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  53.37 
 
 		 293 aa  162  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  53.89 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  48.81 
 
 		 294 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5914  integrase family protein  54.88 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000658468  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.91 
 
 		 311 aa  162  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  55.83 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  47.5 
 
 		 296 aa  161  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.76 
 
 		 311 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  46.48 
 
 		 304 aa  160  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  52.47 
 
 		 294 aa  160  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  47.42 
 
 		 343 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  48.89 
 
 		 294 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  40.87 
 
 		 291 aa  159  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  47.53 
 
 		 310 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  42.7 
 
 		 299 aa  159  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  53.05 
 
 		 302 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.17 
 
 		 311 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  50.86 
 
 		 311 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.53 
 
 		 313 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  46.95 
 
 		 343 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  51.88 
 
 		 324 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  50 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  53.89 
 
 		 380 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  51.23 
 
 		 294 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  45.98 
 
 		 310 aa  157  4e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  29.8 
 
 		 338 aa  157  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0409  Phage integrase  52.41 
 
 		 317 aa  157  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.383536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  50.3 
 
 		 302 aa  157  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  35.28 
 
 		 336 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  51.23 
 
 		 296 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0380  tyrosine recombinase XerC  52.41 
 
 		 304 aa  156  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  54.17 
 
 		 311 aa  157  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  50.3 
 
 		 300 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  55.15 
 
 		 300 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.63 
 
 		 298 aa  156  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  50.3 
 
 		 300 aa  156  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  55.15 
 
 		 300 aa  156  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  55.15 
 
 		 300 aa  156  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.63 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  43.63 
 
 		 298 aa  156  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.63 
 
 		 298 aa  156  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  49.7 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  50.3 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  50.28 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  43.63 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  50.3 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  50.3 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.63 
 
 		 298 aa  156  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  54.71 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.63 
 
 		 298 aa  156  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.63 
 
 		 298 aa  156  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.64 
 
 		 313 aa  155  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  49.1 
 
 		 303 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  52.1 
 
 		 344 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  50 
 
 		 294 aa  155  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  43.15 
 
 		 291 aa  155  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  53.94 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  55.42 
 
 		 329 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  52.91 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  42.03 
 
 		 299 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  47.27 
 
 		 296 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  53.66 
 
 		 312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  53.42 
 
 		 326 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  49.09 
 
 		 296 aa  154  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  52.1 
 
 		 298 aa  153  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  48.89 
 
 		 297 aa  153  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  50.62 
 
 		 301 aa  153  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.9 
 
 		 303 aa  153  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.9 
 
 		 303 aa  153  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.29 
 
 		 296 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  47.9 
 
 		 303 aa  153  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  48.5 
 
 		 302 aa  153  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0221  phage integrase  46.95 
 
 		 349 aa  153  8e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.118358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3973  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.67 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.556004  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  51.85 
 
 		 298 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  50.9 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>