More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0567 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  41.83 
 
 		 1037 aa  780    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 1062 aa  2156    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  36.8 
 
 		 868 aa  518  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  34.55 
 
 		 875 aa  480  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  36.62 
 
 		 830 aa  477  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  33.58 
 
 		 893 aa  448  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  35.1 
 
 		 853 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.63 
 
 		 853 aa  446  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  32.81 
 
 		 870 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  37.17 
 
 		 884 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  33.49 
 
 		 868 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  33.02 
 
 		 887 aa  414  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  32.83 
 
 		 898 aa  416  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  32.6 
 
 		 817 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  35.14 
 
 		 918 aa  412  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  35.51 
 
 		 828 aa  392  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  34.35 
 
 		 877 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  31.38 
 
 		 871 aa  357  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.48 
 
 		 861 aa  350  9e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  31.8 
 
 		 819 aa  349  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.67 
 
 		 811 aa  333  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  32.12 
 
 		 859 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  32.57 
 
 		 923 aa  322  3e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  28.78 
 
 		 887 aa  294  6e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  29.48 
 
 		 931 aa  287  8e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.71 
 
 		 869 aa  245  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  33.63 
 
 		 779 aa  232  3e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  35.22 
 
 		 824 aa  231  7e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  36.48 
 
 		 762 aa  227  8e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  31.56 
 
 		 794 aa  226  1e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  34.45 
 
 		 754 aa  219  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  36.74 
 
 		 810 aa  218  4e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  36.18 
 
 		 809 aa  216  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  35.78 
 
 		 809 aa  217  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  34.06 
 
 		 781 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  33.04 
 
 		 758 aa  214  9e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  31.94 
 
 		 761 aa  212  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  32.34 
 
 		 762 aa  210  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  32.97 
 
 		 758 aa  209  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 758 aa  209  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  36.97 
 
 		 790 aa  209  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 		 812 aa  207  7e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0707  PEP-utilising protein mobile region  32.7 
 
 		 866 aa  206  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454506 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  32.39 
 
 		 758 aa  204  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  32.62 
 
 		 799 aa  203  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  29.49 
 
 		 758 aa  202  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  29.6 
 
 		 758 aa  202  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  29.49 
 
 		 758 aa  201  5e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  31.96 
 
 		 769 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  34.61 
 
 		 815 aa  200  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  32.16 
 
 		 795 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  32.67 
 
 		 761 aa  200  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  34.29 
 
 		 760 aa  200  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  29.33 
 
 		 757 aa  199  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  35.76 
 
 		 787 aa  198  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  32.59 
 
 		 789 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  32.59 
 
 		 789 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  32.59 
 
 		 789 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  32.89 
 
 		 789 aa  196  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  30.62 
 
 		 785 aa  195  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  32.82 
 
 		 789 aa  195  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  32.82 
 
 		 789 aa  195  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  34.89 
 
 		 760 aa  194  5e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  31.38 
 
 		 788 aa  194  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  32.37 
 
 		 789 aa  195  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  31.98 
 
 		 780 aa  194  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  31.54 
 
 		 790 aa  194  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  32.59 
 
 		 789 aa  194  7e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  29.91 
 
 		 782 aa  194  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1843  phosphoenolpyruvate synthase  32.09 
 
 		 794 aa  193  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1737  phosphoenolpyruvate synthase  32.09 
 
 		 794 aa  193  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2600  phosphoenolpyruvate synthase  32.09 
 
 		 794 aa  193  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  32.44 
 
 		 797 aa  192  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  32.37 
 
 		 789 aa  192  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  34.13 
 
 		 778 aa  191  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  32.91 
 
 		 784 aa  191  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  32.09 
 
 		 792 aa  191  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  32.08 
 
 		 792 aa  191  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  31.5 
 
 		 792 aa  189  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  32.16 
 
 		 803 aa  189  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  34.57 
 
 		 797 aa  189  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  32.17 
 
 		 808 aa  189  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  31.87 
 
 		 792 aa  188  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  31.87 
 
 		 792 aa  188  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  31.87 
 
 		 792 aa  188  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  31.87 
 
 		 792 aa  188  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  31.87 
 
 		 792 aa  188  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  31.87 
 
 		 792 aa  188  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  31.87 
 
 		 792 aa  188  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1461  phosphoenolpyruvate synthase  31.79 
 
 		 792 aa  188  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1479  phosphoenolpyruvate synthase  31.79 
 
 		 792 aa  188  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328062  normal  0.259297 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  31.79 
 
 		 792 aa  188  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1995  phosphoenolpyruvate synthase  31.79 
 
 		 792 aa  187  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367287  normal  0.176053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  31.95 
 
 		 791 aa  187  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1823  phosphoenolpyruvate synthase  31.79 
 
 		 792 aa  187  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  34.28 
 
 		 792 aa  187  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  31.52 
 
 		 789 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  32.01 
 
 		 792 aa  186  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  31.86 
 
 		 792 aa  186  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  33.26 
 
 		 789 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>