More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0220 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  100 
 
 
218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.8521  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2969  alanyl-tRNA synthetase related protein  53.77 
 
 
214 aa  225  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160659  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2987  metal-dependent hydrolase  46.95 
 
 
226 aa  201  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1334  putative alanyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
213 aa  201  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0660  hypothetical protein  46.54 
 
 
214 aa  191  8e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0644  hypothetical protein  46.54 
 
 
221 aa  191  8e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0131  hypothetical protein  47.22 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0641212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2298  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  45.37 
 
 
212 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003302  alanyl-tRNA synthetase domain protein  44.81 
 
 
213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4713  alanyl tRNA synthetase-related protein  43.06 
 
 
212 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.601356  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2301  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.58 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2194  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.17 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.28 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2509  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  32.3 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2316  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.17 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2278  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.77 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1666  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.86 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346483  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1000  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.58 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332977  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4224  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.33 
 
 
236 aa  82  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4323  synthetase, putative  30.34 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2345  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  32.73 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0988  hypothetical protein  30.16 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169723  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5605  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 
243 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675577  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1255  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  29.15 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0379  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  29.15 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0770  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  29.15 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1096  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  29.15 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4302  synthetase, putative  30.21 
 
 
262 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.646666  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1402  alanyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 
243 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1111  synthetase, putative  30.21 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.176588 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1150  synthetase, putative  29.79 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0599146  normal  0.802365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  26.21 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1263  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  28.74 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0478  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  21.1 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0918  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.69 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  28.76 
 
 
914 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
880 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0849  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.54 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 
892 aa  72  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 
910 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 
892 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.07 
 
 
389 aa  68.9  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1995  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  27 
 
 
883 aa  68.6  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4455  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0634638 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 
881 aa  68.2  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  31.82 
 
 
894 aa  67.8  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0731  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.97 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1136  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.31 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000475056  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4712  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.32 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0289109  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1345  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  27.08 
 
 
249 aa  67  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0330  alanyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 
886 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43097  normal  0.0181617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2035  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.08 
 
 
243 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0367  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  29.13 
 
 
252 aa  67  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1268  alanyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 
876 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
889 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1034  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  26.23 
 
 
238 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000152795 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1428  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  25.32 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1030  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  28.03 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.08615  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3126  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.69 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.64 
 
 
387 aa  65.5  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 
892 aa  65.5  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
913 aa  65.1  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  25.54 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  25.54 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3303  alanyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 
871 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.243985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  29.79 
 
 
923 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2313  aminoacyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 
239 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.938515  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 
876 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4881  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.03 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3853  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 
250 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1468  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.36 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  27.43 
 
 
878 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5692  putative alanyl-tRNA synthetase related protein  25.21 
 
 
243 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0809019  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 
876 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0821  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  28.98 
 
 
239 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 
876 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 
876 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2181  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  25.86 
 
 
235 aa  63.5  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.290102  hitchhiker  0.0000501949 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  28.45 
 
 
876 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 
874 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1549  alanine--tRNA ligase  25.54 
 
 
236 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0332631  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0156  alanyl-tRNA synthetase  26.46 
 
 
848 aa  63.5  0.000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 
875 aa  63.2  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 
882 aa  62.8  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0823  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.02 
 
 
239 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0624764  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 
884 aa  62.8  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  26.21 
 
 
889 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  25.43 
 
 
236 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 
892 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2149  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  31.02 
 
 
239 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287127  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 
913 aa  62.4  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2498  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.2 
 
 
432 aa  62.4  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0615615  normal  0.305601 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.56 
 
 
265 aa  62  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1534  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  27.5 
 
 
238 aa  62  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11001  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1793  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  25.54 
 
 
236 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 
904 aa  62  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
874 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
874 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2025  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  28.7 
 
 
240 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>