72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1193 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 334 aa  641    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.475226 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0547  hypothetical protein  62.5 
 
 		 319 aa  331  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.059421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0791  hypothetical protein  55.56 
 
 		 353 aa  299  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0217127  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.82 
 
 		 295 aa  182  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.221169  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0335  hypothetical protein  37.91 
 
 		 302 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5783  hypothetical protein  36.03 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614473  hitchhiker  0.00280675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  34.8 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0667  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.26 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.86 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1197  hypothetical protein  27.53 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.575187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1193  DMT superfamily efflux pump  25.51 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.516165 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3517  hypothetical protein  32.81 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  26.13 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  26.41 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  27.94 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.62 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.7 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  30.94 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.08 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.08 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  29.44 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  29.44 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  28.52 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  29.44 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  27.09 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.57 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  29.63 
 
 		 281 aa  53.5  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  29.63 
 
 		 281 aa  53.5  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  28.24 
 
 		 306 aa  52.8  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  26.15 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  24.91 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.75 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  26.15 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  32.56 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  25.77 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3010  hypothetical protein  26.38 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  26.04 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0090  hypothetical protein  32.98 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  25.98 
 
 		 300 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  25.78 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  23.72 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  26.98 
 
 		 345 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  27.31 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.95 
 
 		 307 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  25.57 
 
 		 293 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.16 
 
 		 297 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  29.1 
 
 		 311 aa  47  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  29.5 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2973  hypothetical protein  19.68 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  28 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  28.43 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.4 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  26.71 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  29.2 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.91 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  25.91 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  24.91 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  26.72 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.55 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.29 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.34 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  26.56 
 
 		 301 aa  43.1  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  22.97 
 
 		 308 aa  42.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  25.86 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  25.88 
 
 		 302 aa  42.7  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  25.86 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  25.86 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  26.72 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  22.16 
 
 		 301 aa  42.4  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  25.86 
 
 		 309 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  25.86 
 
 		 303 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>