59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1062 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  100 
 
 		 530 aa  1070    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0655  hypothetical protein  54.67 
 
 		 350 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1065  hypothetical protein  44.97 
 
 		 775 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0270442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  36.27 
 
 		 817 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  43.31 
 
 		 682 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  41.72 
 
 		 259 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  42.67 
 
 		 689 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  45.45 
 
 		 646 aa  98.6  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  41.61 
 
 		 259 aa  98.2  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  42 
 
 		 166 aa  97.8  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  43.51 
 
 		 621 aa  95.1  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  34.69 
 
 		 340 aa  90.5  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  40.85 
 
 		 140 aa  82  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  36.6 
 
 		 485 aa  79.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  38.85 
 
 		 157 aa  78.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  39.57 
 
 		 532 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  37.76 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  35.57 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  38.26 
 
 		 557 aa  73.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  49.33 
 
 		 498 aa  70.9  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  34.73 
 
 		 225 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  31.18 
 
 		 262 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  33.12 
 
 		 554 aa  67  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  33.33 
 
 		 196 aa  67  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  27.54 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  33.93 
 
 		 180 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  33.93 
 
 		 179 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1761  hypothetical protein  35.61 
 
 		 805 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  43.02 
 
 		 654 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  43.02 
 
 		 654 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  45.95 
 
 		 401 aa  63.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  43.75 
 
 		 176 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  45.95 
 
 		 183 aa  61.6  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  44.44 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  29.82 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  35.71 
 
 		 519 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  38.67 
 
 		 402 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  33.52 
 
 		 483 aa  55.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  33.99 
 
 		 492 aa  52  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  35.29 
 
 		 320 aa  52  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1141  tail fiber domain-containing protein  30.91 
 
 		 527 aa  52  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  34.95 
 
 		 536 aa  51.2  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  32.58 
 
 		 1007 aa  50.4  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  35 
 
 		 368 aa  50.4  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5633  hypothetical protein  26.87 
 
 		 866 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3903  hypothetical protein  29.45 
 
 		 439 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0432059  normal  0.0187959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  34.12 
 
 		 281 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  32.93 
 
 		 516 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  32.93 
 
 		 536 aa  48.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  37.11 
 
 		 790 aa  47.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2442  Tail Collar domain protein  37.68 
 
 		 282 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0240  microcystin-dependent protein-like  27.32 
 
 		 268 aa  47  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  32.5 
 
 		 1137 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  32.5 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  32.5 
 
 		 1120 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  37.25 
 
 		 735 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  32.31 
 
 		 962 aa  45.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  27.5 
 
 		 505 aa  44.3  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0711  hypothetical protein  27.21 
 
 		 524 aa  43.9  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.983836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>