14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1761 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1761  hypothetical protein  100 
 
 		 805 aa  1650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5633  hypothetical protein  44.77 
 
 		 866 aa  146  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2438  hypothetical protein  39.26 
 
 		 840 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  34.93 
 
 		 555 aa  103  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  34.93 
 
 		 555 aa  102  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  34.93 
 
 		 555 aa  102  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  34.45 
 
 		 555 aa  101  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5675  hypothetical protein  35.39 
 
 		 1065 aa  94  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  33.65 
 
 		 554 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1998  hypothetical protein  33.04 
 
 		 497 aa  90.5  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0054926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4120  hypothetical protein  34.59 
 
 		 1371 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.189457 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  35.61 
 
 		 530 aa  65.1  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1065  hypothetical protein  31.78 
 
 		 775 aa  59.3  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0270442  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3548  hypothetical protein  71.43 
 
 		 505 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896627  normal  0.0134633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>