15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1998 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1998  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  990    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0054926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  42.65 
 
 		 555 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  42.65 
 
 		 555 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  42.16 
 
 		 555 aa  120  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  41.18 
 
 		 555 aa  118  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  45.98 
 
 		 554 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2438  hypothetical protein  41.62 
 
 		 840 aa  106  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4120  hypothetical protein  38.37 
 
 		 1371 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.189457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1761  hypothetical protein  33.63 
 
 		 805 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4170  hypothetical protein  39.36 
 
 		 796 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4196  hypothetical protein  39.36 
 
 		 796 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3320  hypothetical protein  39.36 
 
 		 796 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5633  hypothetical protein  33.63 
 
 		 866 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5675  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1065 aa  44.3  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4265  hypothetical protein  35.64 
 
 		 574 aa  43.1  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.877453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>