More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1087 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1087  trigger factor  100 
 
 
431 aa  834    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.283245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  31.91 
 
 
429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  31.35 
 
 
427 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  30.64 
 
 
425 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  30.64 
 
 
425 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  30.64 
 
 
425 aa  202  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  30.64 
 
 
425 aa  202  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  30.64 
 
 
425 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  30.64 
 
 
425 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  30.4 
 
 
425 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  30.33 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  30.17 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  29.18 
 
 
435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  30.17 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  29.69 
 
 
425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  30.02 
 
 
428 aa  193  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  34.13 
 
 
446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  28.81 
 
 
433 aa  190  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  31.41 
 
 
428 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  30.93 
 
 
478 aa  179  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  28.81 
 
 
433 aa  179  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  28.81 
 
 
433 aa  179  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  32.58 
 
 
500 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  31.21 
 
 
433 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  27.74 
 
 
426 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  28.27 
 
 
438 aa  171  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  27 
 
 
438 aa  169  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  27.32 
 
 
435 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  26.96 
 
 
488 aa  166  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  25.64 
 
 
435 aa  166  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  27.41 
 
 
428 aa  163  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  29.21 
 
 
447 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  31.07 
 
 
438 aa  157  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  26.57 
 
 
446 aa  154  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  29.14 
 
 
448 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  26.29 
 
 
428 aa  152  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  24.82 
 
 
439 aa  152  8e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  27.78 
 
 
447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  24.69 
 
 
436 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  28.31 
 
 
430 aa  146  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  26.6 
 
 
449 aa  140  6e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  26.9 
 
 
432 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  24.38 
 
 
428 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  24.38 
 
 
428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  27.29 
 
 
448 aa  137  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  25.31 
 
 
427 aa  137  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  26.01 
 
 
455 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  26.01 
 
 
455 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17811  trigger factor  26.24 
 
 
471 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  26.74 
 
 
439 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  25.06 
 
 
433 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  25.94 
 
 
427 aa  133  5e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  27.21 
 
 
440 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  26.81 
 
 
426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  24.12 
 
 
447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  27.11 
 
 
435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09030  trigger factor  24.94 
 
 
547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.001374  normal  0.491462 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0690  trigger factor  27.59 
 
 
452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.110264  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  24.34 
 
 
469 aa  130  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00701  trigger factor  25.77 
 
 
479 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  23.63 
 
 
461 aa  129  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  24.77 
 
 
471 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  23.47 
 
 
465 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  25.64 
 
 
438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  25.53 
 
 
424 aa  127  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  26.27 
 
 
433 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  26.1 
 
 
432 aa  127  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  25.2 
 
 
482 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  25.2 
 
 
478 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  25.2 
 
 
478 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  26.83 
 
 
473 aa  126  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2165  trigger factor  26.05 
 
 
484 aa  126  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0536856 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  25.24 
 
 
437 aa  126  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  22.92 
 
 
454 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1477  trigger factor  25.55 
 
 
506 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.571552  normal  0.413399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  24.75 
 
 
479 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  25.91 
 
 
427 aa  125  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  26.83 
 
 
479 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  24.59 
 
 
431 aa  123  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0614  trigger factor  27.42 
 
 
474 aa  122  8e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000543621  normal  0.981656 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1894  trigger factor  26.23 
 
 
432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2739  trigger factor  24.66 
 
 
440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138547  decreased coverage  0.00279907 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  26.47 
 
 
500 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0517  trigger factor  27.94 
 
 
428 aa  121  3e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  22.86 
 
 
448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  24.47 
 
 
481 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  25.64 
 
 
483 aa  120  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  23.72 
 
 
435 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  23.41 
 
 
466 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  25.22 
 
 
481 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  25.91 
 
 
451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  23.21 
 
 
435 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  23.68 
 
 
433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1719  trigger factor  23.1 
 
 
434 aa  117  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1929  trigger factor  23.75 
 
 
501 aa  116  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000213413  normal  0.0186919 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0432  trigger factor-like protein  26.08 
 
 
449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.746962  normal  0.196981 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  25 
 
 
443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  24.31 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  24.42 
 
 
463 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2566  trigger factor  23.04 
 
 
435 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>