More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3970 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 366 aa  743    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  65.55 
 
 		 332 aa  471  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  60.71 
 
 		 383 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  57.92 
 
 		 377 aa  449  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  58.94 
 
 		 367 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  58.54 
 
 		 380 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  63.41 
 
 		 330 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  58.54 
 
 		 380 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  58.26 
 
 		 380 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  58.26 
 
 		 380 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  58.73 
 
 		 368 aa  435  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  57.59 
 
 		 373 aa  430  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  57.98 
 
 		 367 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  57.78 
 
 		 372 aa  429  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  63.91 
 
 		 330 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  60.56 
 
 		 326 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  60.56 
 
 		 326 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  60.25 
 
 		 327 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  60.25 
 
 		 326 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  54.32 
 
 		 371 aa  412  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  60.25 
 
 		 326 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  56.55 
 
 		 366 aa  411  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  53.98 
 
 		 364 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  56.21 
 
 		 357 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  53.69 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  60.56 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  52.09 
 
 		 369 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  55.59 
 
 		 334 aa  403  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  53.17 
 
 		 367 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  52.89 
 
 		 367 aa  396  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  55.71 
 
 		 375 aa  396  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  51.64 
 
 		 367 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  58.2 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  50.68 
 
 		 365 aa  387  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  50.42 
 
 		 372 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  54.63 
 
 		 331 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  57.32 
 
 		 332 aa  380  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  53.59 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  49.17 
 
 		 372 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  52.38 
 
 		 366 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  50.28 
 
 		 367 aa  373  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  48.89 
 
 		 372 aa  371  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  50.84 
 
 		 374 aa  373  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2216  peptide chain release factor 2 (bRF-2)  58.56 
 
 		 344 aa  371  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00549966  hitchhiker  0.00000471368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  52.79 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  48.9 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  51.4 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  51.94 
 
 		 372 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  51.1 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  52.35 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  51.33 
 
 		 364 aa  364  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  49.32 
 
 		 371 aa  364  1e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  53.14 
 
 		 362 aa  363  2e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  50.56 
 
 		 365 aa  363  3e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  50 
 
 		 365 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  47.63 
 
 		 370 aa  361  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  55.42 
 
 		 326 aa  360  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  50.85 
 
 		 375 aa  360  3e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  49.72 
 
 		 365 aa  360  3e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  53.4 
 
 		 332 aa  360  3e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  47.53 
 
 		 367 aa  359  5e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  49.72 
 
 		 365 aa  358  6e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  51.55 
 
 		 329 aa  358  7e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  50.6 
 
 		 337 aa  358  9e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  50.84 
 
 		 378 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  48.08 
 
 		 364 aa  354  1e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  50.44 
 
 		 356 aa  353  2e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  47.68 
 
 		 371 aa  353  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  48.6 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  48.6 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  49.12 
 
 		 358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  48.6 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  49.18 
 
 		 369 aa  353  4e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  48.36 
 
 		 368 aa  352  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  49.15 
 
 		 365 aa  352  5e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  48.31 
 
 		 365 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  50.73 
 
 		 356 aa  351  1e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  47.8 
 
 		 376 aa  351  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 375 aa  350  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  48.31 
 
 		 365 aa  350  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  45.83 
 
 		 371 aa  349  5e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  48.33 
 
 		 364 aa  348  7e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  49.72 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  48.61 
 
 		 376 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  49.56 
 
 		 356 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  48.76 
 
 		 368 aa  347  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  46.98 
 
 		 376 aa  347  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  48.6 
 
 		 379 aa  347  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  54.66 
 
 		 330 aa  346  4e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  48.31 
 
 		 378 aa  345  5e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  46.7 
 
 		 375 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  50.45 
 
 		 340 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  50.65 
 
 		 317 aa  343  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0923  peptide chain release factor 2  54.72 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  49.03 
 
 		 375 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  47.8 
 
 		 375 aa  343  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  46.13 
 
 		 369 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  49.03 
 
 		 365 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  51.56 
 
 		 343 aa  342  5e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>