207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3476 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3476  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 
283 aa  588  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  29.74 
 
 
311 aa  90.9  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  40.56 
 
 
145 aa  89  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  38.46 
 
 
144 aa  85.9  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  38.26 
 
 
183 aa  85.5  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  36.62 
 
 
138 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  35.51 
 
 
160 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  36.13 
 
 
150 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  43.12 
 
 
133 aa  80.9  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  36.11 
 
 
150 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  31.65 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  32.03 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  35 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  35.77 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  34.29 
 
 
147 aa  78.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  36.94 
 
 
180 aa  78.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  33.54 
 
 
153 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  32.12 
 
 
135 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  32.14 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  30.9 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  32.86 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  40.57 
 
 
182 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  29.41 
 
 
183 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  39.5 
 
 
182 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  30.5 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  32.91 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  30.46 
 
 
175 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  32.69 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  28.44 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  32.88 
 
 
155 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  31.54 
 
 
160 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  36.54 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  29.14 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  42.11 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  40.78 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  35.38 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  33.77 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  41.67 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  36.79 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  37.14 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  26.04 
 
 
166 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  36.28 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  30.43 
 
 
157 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  33.78 
 
 
151 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  39.13 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  36.54 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  39 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  37.14 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  32.17 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  33.09 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  34.29 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  27.32 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  36.19 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  31.33 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  30.82 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  32.81 
 
 
157 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  33.82 
 
 
151 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  30.87 
 
 
160 aa  68.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  37.37 
 
 
157 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  32.81 
 
 
157 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  36.79 
 
 
165 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  37.07 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  32.74 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  32.81 
 
 
157 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  32.03 
 
 
157 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  32.03 
 
 
157 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  36.79 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  30.13 
 
 
166 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  30 
 
 
160 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  35.51 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0535  hypothetical protein  32.37 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  36.94 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  37.37 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  32.59 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  37.25 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  36.28 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  39.25 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  28.4 
 
 
167 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  31.72 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2599  protein of unknown function UPF0066  30 
 
 
158 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273401  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  31.72 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  36.36 
 
 
157 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  38.95 
 
 
145 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  31.72 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  31.72 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  31.72 
 
 
246 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  32.11 
 
 
139 aa  63.9  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  36.19 
 
 
157 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  29.77 
 
 
142 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  34.19 
 
 
161 aa  63.9  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  36.17 
 
 
233 aa  63.5  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  30 
 
 
265 aa  63.5  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  34.51 
 
 
235 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  34.51 
 
 
235 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  34.51 
 
 
235 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  34.51 
 
 
235 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>