More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3082 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
550 aa  1121    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0910  metal dependent phosphohydrolase  53.65 
 
 
561 aa  594  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.69967  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  41.67 
 
 
563 aa  359  7e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  37.88 
 
 
564 aa  357  5e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  37.78 
 
 
505 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  38.48 
 
 
545 aa  269  8.999999999999999e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.38 
 
 
1073 aa  269  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  38.01 
 
 
792 aa  265  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.5 
 
 
841 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2652  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
608 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  37.24 
 
 
836 aa  257  4e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  66.1 
 
 
546 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00093231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.21 
 
 
1125 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  30.17 
 
 
836 aa  205  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4714  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
684 aa  204  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0273  metal dependent phosphohydrolase  34.41 
 
 
534 aa  203  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.576727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  35.33 
 
 
599 aa  200  6e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.83 
 
 
483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.96 
 
 
971 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.45 
 
 
755 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2408  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.99 
 
 
623 aa  196  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
814 aa  194  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.27 
 
 
719 aa  194  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.77 
 
 
960 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0169  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 
681 aa  192  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4565  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.78 
 
 
833 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0183003  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0780  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.3 
 
 
520 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0195559  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  34.37 
 
 
619 aa  191  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.75 
 
 
853 aa  188  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.52 
 
 
1338 aa  187  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0011  putative PAS/PAC sensor protein  31.05 
 
 
526 aa  186  7e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.140902  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2203  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
434 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 
593 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2450  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.02 
 
 
617 aa  184  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2443  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.11 
 
 
912 aa  183  8.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1469  HD-GYP domain-containing protein  33.16 
 
 
803 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0383  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.31 
 
 
746 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1164  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  33.68 
 
 
599 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0260621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  45.7 
 
 
363 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2934  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 
683 aa  177  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2224  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.03 
 
 
500 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000178543  decreased coverage  1.10821e-21 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2407  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.67 
 
 
758 aa  173  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0210  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 
465 aa  173  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3953  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  29.84 
 
 
474 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778513 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0162  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.29 
 
 
837 aa  172  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.07 
 
 
343 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  41.4 
 
 
487 aa  167  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  45.45 
 
 
550 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  46.11 
 
 
481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  42.55 
 
 
692 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  35.27 
 
 
615 aa  164  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  43.78 
 
 
387 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  46.33 
 
 
710 aa  163  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  40.54 
 
 
465 aa  163  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.77 
 
 
328 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 
703 aa  161  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  39.56 
 
 
428 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  43.89 
 
 
703 aa  160  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  42.13 
 
 
770 aa  159  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 
366 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  43.5 
 
 
553 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  40.86 
 
 
648 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2803  metal dependent phosphohydrolase  43.02 
 
 
448 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  42.39 
 
 
424 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  45.66 
 
 
371 aa  157  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  44.32 
 
 
545 aa  157  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  38.14 
 
 
444 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  41.24 
 
 
339 aa  156  8e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4265  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  28.61 
 
 
539 aa  156  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  41.44 
 
 
407 aa  156  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  45.2 
 
 
712 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 
350 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  39.81 
 
 
518 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1840  metal dependent phosphohydrolase  30.64 
 
 
540 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  41.11 
 
 
650 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  41.71 
 
 
548 aa  154  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  40.33 
 
 
438 aa  154  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 
718 aa  153  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1339  metal dependent phosphohydrolase  41.49 
 
 
463 aa  153  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000978961  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  41.95 
 
 
618 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  45.56 
 
 
611 aa  153  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  42.05 
 
 
334 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  38.71 
 
 
349 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.83 
 
 
331 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  38.54 
 
 
499 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  43.9 
 
 
547 aa  152  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  43.9 
 
 
547 aa  152  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  41.28 
 
 
177 aa  151  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  41.34 
 
 
357 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  42.05 
 
 
334 aa  151  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.57 
 
 
348 aa  150  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0978  metal dependent phosphohydrolase  46.24 
 
 
558 aa  150  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000628602  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1811  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.67 
 
 
347 aa  150  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  39.89 
 
 
320 aa  150  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  40.33 
 
 
649 aa  149  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.44 
 
 
491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  43.09 
 
 
373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  40.88 
 
 
451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  40.72 
 
 
339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.48 
 
 
334 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>