More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0869 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0869  response regulator receiver protein  100 
 
 		 119 aa  243  4.9999999999999997e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.588002  normal  0.840358 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3714  response regulator receiver domain-containing protein  63.56 
 
 		 131 aa  169  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2551  response regulator receiver protein  62.71 
 
 		 322 aa  169  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2719  response regulator receiver protein  64.66 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2257  response regulator receiver protein  61.34 
 
 		 120 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0575  response regulator receiver protein  59.83 
 
 		 117 aa  150  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0870  response regulator receiver protein  59.83 
 
 		 117 aa  150  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.226165  normal  0.635424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2592  two component transcriptional regulator, Fis family  52.99 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2411  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133639  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3713  response regulator receiver domain-containing protein  34.88 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0140  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3956  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 231 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1850  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.549411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0811  nitrogen regulation protein NtrX  38.71 
 
 		 456 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.686874  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0173  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 1651 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.15 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1201  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0883705  hitchhiker  0.00883957 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5999  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.76 
 
 		 434 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 858 aa  66.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.76 
 
 		 434 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1826  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3548  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2784  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0945133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2377  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2718  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0221  response regulator receiver domain-containing protein  29.06 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  34.55 
 
 		 544 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25160  response regulator  35.25 
 
 		 356 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.61 
 
 		 236 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.89 
 
 		 231 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  30.08 
 
 		 229 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.1 
 
 		 461 aa  64.3  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 1832 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 236 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0626  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0991172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2230  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 707 aa  63.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.8 
 
 		 236 aa  63.5  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3719  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.173125  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3665  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0614  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0289  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  32.48 
 
 		 1299 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1930  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.465475  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3764  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.105051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 977 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 509 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.76 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  31.9 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390474  normal  0.0307837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  28.45 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  35 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3985  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  31.9 
 
 		 394 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.17 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0549  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 1362 aa  62  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2233  response regulator receiver protein  34.57 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250128  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 235 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2393  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 		 518 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  0.0787545 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5170  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2593  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.03 
 
 		 340 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.483  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0241  LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 216 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 		 1002 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0776  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 454 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2955  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.45 
 
 		 308 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  32.73 
 
 		 1361 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2773  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  30.77 
 
 		 1427 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  32.76 
 
 		 326 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1745  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  31.03 
 
 		 468 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1377  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.71 
 
 		 462 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244526  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.09 
 
 		 222 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  33.75 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 511 aa  61.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.17 
 
 		 488 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  31.25 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.27 
 
 		 249 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  29.75 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 1426 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.93 
 
 		 472 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4374  response regulator receiver protein  27.69 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.45297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>