More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0173 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0173  response regulator receiver protein  100 
 
 		 119 aa  234  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 140 aa  94  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2544  DNA binding domain protein, excisionase family  36.67 
 
 		 264 aa  86.3  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0361834  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3844  response regulator receiver domain-containing protein  41.59 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3985  response regulator receiver protein  43.27 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0241  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3907  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2593  response regulator receiver domain-containing protein  36.94 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1255  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.135587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1356  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0440939  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3833  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_137  DNA-binding response regulator  36.75 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2657  response regulator receiver  37.72 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  0.494085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1937  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1714  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1739  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 1651 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3956  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314568 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0280  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 295 aa  78.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.932912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1568  response regulator receiver protein  35 
 
 		 476 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  35 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 231 aa  77  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  33.93 
 
 		 460 aa  76.3  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4431  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2803  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  36.97 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2044  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0300859  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1407  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  36.13 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000138709 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1473  response regulator receiver protein  35 
 
 		 477 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0877  response regulator  34.15 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200847  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 1415 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 		 1118 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 433 aa  75.5  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  41.98 
 
 		 309 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  35.59 
 
 		 934 aa  75.1  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0247  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.26 
 
 		 890 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3548  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  31.15 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0504  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0548558  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  39.05 
 
 		 1355 aa  73.9  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2391  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 469 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 309 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 373 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1343  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1826  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 363 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3719  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.173125  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3665  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0926  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  32.23 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.76006  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  35.4 
 
 		 1374 aa  72.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4785  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.692787 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  33.06 
 
 		 1296 aa  72.4  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  40.95 
 
 		 356 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1476  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 453 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832694  normal  0.439282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2046  response regulator  31.62 
 
 		 404 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0075  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  38.75 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.124346  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.61 
 
 		 326 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0573  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.087024  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.19 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2226  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.561592  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0130  response regulator  34.19 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  32.23 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  32.2 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  36.44 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  37.14 
 
 		 1335 aa  71.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  36.67 
 
 		 403 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  37.74 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  32.5 
 
 		 458 aa  70.9  0.000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  33.64 
 
 		 1373 aa  70.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  36.21 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  34.82 
 
 		 230 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  36.29 
 
 		 239 aa  71.2  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  38.84 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  36.29 
 
 		 239 aa  71.2  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3109  response regulator receiver  35.04 
 
 		 285 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0893452  normal  0.677049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3134  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 500 aa  70.9  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.82 
 
 		 230 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.82 
 
 		 230 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>