More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0780 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0780  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  100 
 
 
520 aa  1073    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0195559  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.86 
 
 
1338 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0383  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  56.91 
 
 
746 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.23 
 
 
853 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.76 
 
 
971 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  52.23 
 
 
755 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4565  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  52.96 
 
 
833 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0183003  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  42.83 
 
 
836 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3953  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  45.96 
 
 
474 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778513 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  50.29 
 
 
960 aa  359  8e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0011  putative PAS/PAC sensor protein  39.96 
 
 
526 aa  357  3.9999999999999996e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.140902  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.5 
 
 
483 aa  324  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1146  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  41.56 
 
 
909 aa  323  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  39.83 
 
 
619 aa  320  3.9999999999999996e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0210  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.91 
 
 
465 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74546  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40.21 
 
 
593 aa  307  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2203  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  44.58 
 
 
434 aa  301  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2408  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.94 
 
 
623 aa  296  7e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2450  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  43.68 
 
 
617 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  43.09 
 
 
719 aa  289  7e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  41.93 
 
 
814 aa  283  6.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  37.89 
 
 
599 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1469  HD-GYP domain-containing protein  36.36 
 
 
803 aa  280  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1164  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  37.68 
 
 
599 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0260621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1840  metal dependent phosphohydrolase  38.92 
 
 
540 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0162  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 
837 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2443  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.77 
 
 
912 aa  267  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2224  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.26 
 
 
500 aa  256  9e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000178543  decreased coverage  1.10821e-21 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2407  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.5 
 
 
758 aa  253  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4265  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.11 
 
 
539 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0169  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.8 
 
 
681 aa  228  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.92 
 
 
1073 aa  219  7.999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  32.47 
 
 
505 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  33.95 
 
 
545 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  34.59 
 
 
563 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  34.59 
 
 
564 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  33.24 
 
 
792 aa  208  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0910  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 
561 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.69967  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  33.52 
 
 
836 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.33 
 
 
841 aa  203  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2934  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.02 
 
 
683 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.3 
 
 
550 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1694  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 
579 aa  188  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.03 
 
 
1125 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2652  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.8 
 
 
608 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  39.62 
 
 
357 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  46.82 
 
 
465 aa  169  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 
487 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.1 
 
 
880 aa  166  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.77 
 
 
860 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.49 
 
 
357 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4714  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 
684 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.49 
 
 
357 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  42.71 
 
 
220 aa  163  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0273  metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 
534 aa  163  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.576727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0639  metal dependent phosphohydrolase  46.55 
 
 
210 aa  162  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000043249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  46.93 
 
 
334 aa  161  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  45.55 
 
 
518 aa  161  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.19 
 
 
357 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  45.6 
 
 
719 aa  160  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1432  metal dependent phosphohydrolase  42.13 
 
 
207 aa  159  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000116071  normal  0.0291247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1949  metal dependent phosphohydrolase  44.25 
 
 
226 aa  159  9e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000478205  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  40.11 
 
 
876 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  45.81 
 
 
334 aa  159  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  41.88 
 
 
615 aa  158  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  45.71 
 
 
632 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  40.72 
 
 
481 aa  158  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.76 
 
 
513 aa  156  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  40.21 
 
 
618 aa  156  8e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  40.72 
 
 
547 aa  156  8e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  40.72 
 
 
547 aa  156  8e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.94 
 
 
351 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  44.09 
 
 
197 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  42.7 
 
 
718 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44 
 
 
343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.13 
 
 
334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1184  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.06 
 
 
394 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  29.11 
 
 
652 aa  154  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  42.7 
 
 
692 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  41.95 
 
 
363 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  42.78 
 
 
770 aa  153  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2111  metal dependent phosphohydrolase  45.28 
 
 
201 aa  153  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  39.67 
 
 
308 aa  153  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  42.37 
 
 
703 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  40.1 
 
 
561 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  35.91 
 
 
553 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2833  metal dependent phosphohydrolase  43.58 
 
 
379 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0209293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  44.26 
 
 
366 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  39.23 
 
 
495 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  42.37 
 
 
703 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  43.86 
 
 
1171 aa  151  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  43.5 
 
 
712 aa  149  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  41.42 
 
 
718 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  42.11 
 
 
357 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.68 
 
 
348 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00581699  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  35.07 
 
 
349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.73 
 
 
375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  38.04 
 
 
298 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  39.67 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  38.81 
 
 
648 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>