More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0847 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1793  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.14 
 
 		 668 aa  732    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0847  alpha amylase all-beta  100 
 
 		 684 aa  1417    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1751  glycoside hydrolase family 13 domain protein  52.25 
 
 		 678 aa  660    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.913589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0990  alpha amylase all-beta  56.45 
 
 		 654 aa  769    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1345  glycogen branching protein  50.82 
 
 		 672 aa  674    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00189715  normal  0.1395 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0205  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.42 
 
 		 662 aa  637    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.119516  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03810  1,4-alpha-glucan branching enzyme, putative  46.5 
 
 		 682 aa  609  1e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0145  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.68 
 
 		 647 aa  609  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02314  1,4-alpha-glucan-branching enzyme (EC 2.4.1.18)(Glycogen-branching enzyme) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9Y8H3]  47.19 
 
 		 684 aa  608  9.999999999999999e-173  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.891119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88710  alpha-1,4-glucan branching enzyme  43.77 
 
 		 701 aa  583  1.0000000000000001e-165  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314091 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45076  predicted protein  45.16 
 
 		 710 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0841943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31320  predicted protein  43.65 
 
 		 751 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00613314  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1321  alpha amylase all-beta  41.78 
 
 		 679 aa  475  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.475758  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.32 
 
 		 731 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.9 
 
 		 639 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  29.32 
 
 		 740 aa  220  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1559  glycogen branching enzyme  26.71 
 
 		 659 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.018797  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.73 
 
 		 721 aa  218  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  30.2 
 
 		 621 aa  217  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.4 
 
 		 732 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.13 
 
 		 731 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.11 
 
 		 770 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.06 
 
 		 633 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1840  glycogen branching enzyme  26.71 
 
 		 659 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.4 
 
 		 735 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.62 
 
 		 668 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.46 
 
 		 784 aa  212  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3094  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.34 
 
 		 646 aa  212  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302104  normal  0.0711873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.46 
 
 		 784 aa  212  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001105  1,4-alpha-glucan (glycogen) branching enzyme  28.52 
 
 		 748 aa  211  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3200  glycogen branching enzyme  28.2 
 
 		 648 aa  211  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  29.84 
 
 		 716 aa  210  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  29.18 
 
 		 716 aa  210  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  28.38 
 
 		 677 aa  209  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.77 
 
 		 785 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1636  glycogen branching enzyme  30.59 
 
 		 729 aa  209  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06930  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.04 
 
 		 630 aa  208  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  29.9 
 
 		 722 aa  207  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  28.52 
 
 		 742 aa  206  9e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  29.26 
 
 		 834 aa  206  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.49 
 
 		 743 aa  205  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.37 
 
 		 1217 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  28.59 
 
 		 716 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.43 
 
 		 768 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0752  glycogen branching enzyme  29.03 
 
 		 750 aa  204  4e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.7 
 
 		 621 aa  204  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  28.07 
 
 		 1224 aa  204  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.67 
 
 		 726 aa  204  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  28.04 
 
 		 727 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  28.04 
 
 		 727 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  27.06 
 
 		 740 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  27.32 
 
 		 749 aa  203  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.6 
 
 		 742 aa  203  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4006  glycogen branching enzyme  28.04 
 
 		 727 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3308  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.43 
 
 		 636 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0744248 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1729  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.21 
 
 		 741 aa  202  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.844267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  32.49 
 
 		 638 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  28.99 
 
 		 765 aa  201  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.21 
 
 		 728 aa  201  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  27.65 
 
 		 749 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  28.11 
 
 		 625 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  28.36 
 
 		 716 aa  201  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  28.5 
 
 		 738 aa  201  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.68 
 
 		 732 aa  201  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.25 
 
 		 747 aa  200  6e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  28.55 
 
 		 1240 aa  200  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.8 
 
 		 728 aa  200  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1530  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.46 
 
 		 736 aa  200  6e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.473268  hitchhiker  0.0000810495 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.55 
 
 		 638 aa  200  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  29.67 
 
 		 743 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  28.74 
 
 		 642 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.45 
 
 		 822 aa  200  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  29.68 
 
 		 749 aa  200  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29 
 
 		 760 aa  200  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  29.67 
 
 		 743 aa  200  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  29.67 
 
 		 743 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3113  glycogen branching enzyme  28.51 
 
 		 638 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.28 
 
 		 736 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  29.67 
 
 		 743 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.91 
 
 		 635 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  28 
 
 		 768 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  28 
 
 		 768 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  28.01 
 
 		 766 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  27.53 
 
 		 728 aa  198  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  27.5 
 
 		 729 aa  198  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2740  glycogen branching enzyme  31.24 
 
 		 736 aa  198  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1334  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.15 
 
 		 743 aa  197  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0398  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.49 
 
 		 646 aa  197  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.930731  normal  0.93639 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.53 
 
 		 761 aa  197  6e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.983775 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1978  glycogen branching enzyme  30.45 
 
 		 632 aa  197  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.8 
 
 		 729 aa  197  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  26.86 
 
 		 755 aa  197  7e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.67 
 
 		 739 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  28.64 
 
 		 748 aa  196  8.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  27.12 
 
 		 723 aa  196  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  28.07 
 
 		 759 aa  196  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  28.68 
 
 		 756 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  27 
 
 		 729 aa  196  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  28.87 
 
 		 725 aa  196  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  28.48 
 
 		 728 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>